针对工程安全问题拒不整改的情况，可以采取以下措施进行处理：

1. 依据合同条款处理：

   • 合同审查：首先，应详细审查施工合同中关于安全问题的条款，特别是关于安全责任、整改义务以及违约责任的部分。如果合同中明确规定了施工单位在发现安全问题后必须立即整改，且拒不整改将承担的违约责任，那么建设单位可以依据合同条款要求施工单位承担相应的违约责任。
   • 违约责任追究：若施工单位拒不整改，建设单位可以依据合同约定，要求施工单位支付违约金、赔偿损失等。在极端情况下，如果施工单位的行为严重违反了合同约定，且对工程安全构成了重大威胁，建设单位甚至有权解除合同，并要求施工单位承担因此造成的全部损失。

2. 行政监管与处罚：

   • 报告监管部门：根据《中华人民共和国安全生产法》等相关法律法规，建设单位或监理单位在发现施工单位拒不整改安全问题时，应及时向当地的安全生产监督管理部门或建设行政主管部门报告。
   • 行政处罚：监管部门在接到报告后，会进行调查核实。如果确认施工单位存在拒不整改安全问题的行为，监管部门将依法对施工单位进行行政处罚，包括但不限于罚款、停产停业整顿、吊销资质证书等。

3. 法律诉讼途径：

   • 提起诉讼：如果施工单位拒不整改且造成了实际损害，建设单位或受损方可以依法向人民法院提起诉讼，要求施工单位承担民事赔偿责任。在诉讼过程中，需要提供充分的证据证明施工单位存在拒不整改安全问题的行为，以及该行为与损害结果之间的因果关系。
   • 证据收集：为了支持诉讼，建设单位或受损方应提前收集并保存好相关证据，如安全检查报告、整改通知、现场照片、视频资料、证人证言等。这些证据将有助于证明施工单位的行为构成违约或侵权，从而支持其诉讼请求。

4. 其他措施：

   • 暂停支付工程款：在施工单位拒不整改安全问题的情况下，建设单位可以依据合同约定或相关法律法规，暂停支付工程款，直至施工单位完成整改并达到安全标准。
   • 引入第三方机构进行整改：如果施工单位拒不整改且情况紧急，建设单位可以考虑引入第三方专业机构进行整改，并要求施工单位承担相关费用。这种方式可以迅速消除安全隐患，保障工程安全。

在处理此类问题时，还需注意以下几点：

• 及时沟通：在发现安全问题后，建设单位应首先与施工单位进行沟通，明确整改要求和期限，并尽量通过协商解决问题。
• 保留证据：在整个处理过程中，建设单位应保留好所有与安全问题相关的证据，以备不时之需。
• 遵循法律程序：在采取任何措施之前，都应确保符合相关法律法规的规定，避免因程序不当而引发新的法律纠纷。

若您在处理工程安全问题拒不整改的情况时遇到任何法律难题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。