结论概述：针对您刚注册的公司与股东意见不合的情况，您确实可以考虑另起公司，但这一决策需谨慎，并需采取一系列措施来避免法律风险。以下是从多个角度为您提供的详细分析和建议。
一、另起公司的法律考量
公司设立的合法性：
- 您有权根据《中华人民共和国公司法》的规定，另行设立新的公司。新公司的设立需满足法定条件，包括但不限于股东人数、注册资本、公司章程等。
- 在设立新公司时，应确保所有设立行为均符合法律法规的要求，避免因设立程序不当而引发的法律风险。
与原公司的关系处理：
- 若您计划在新公司中从事与原公司相同或类似的业务，需特别注意与原公司的竞业禁止和保密义务。若原公司章程或您与原公司签订的协议中有相关限制条款，您应严格遵守，否则可能面临法律责任。
- 同时，您应确保新公司的设立和运营不会损害原公司的利益，包括但不限于客户资源、商业秘密、知识产权等。
二、避免法律风险的措施
完善公司章程和股东协议：
- 在新公司设立之初，应制定完善的公司章程和股东协议，明确股东的权利和义务、决策机制、利润分配等关键条款。这有助于减少未来股东之间的分歧和冲突。
- 特别是对于股东之间的决策机制，应设定明确的表决权比例和决策程序，确保公司决策的合法性和有效性。
明确竞业禁止和保密义务：
- 若您或新公司的其他股东在原公司担任重要职务或掌握核心商业秘密，应在股东协议或相关协议中明确竞业禁止和保密义务。这有助于保护原公司的商业利益，避免不必要的法律纠纷。
- 竞业禁止条款应合理设定期限和范围，确保既不过度限制股东的合法权益，又能有效保护原公司的利益。
妥善处理与原公司的关系：
- 在设立新公司后，您应与原公司保持适当的距离，避免利用原公司的资源或信息为新公司谋取不正当利益。
- 若您计划从原公司离职或转让股权，应按照法律法规和公司章程的规定办理相关手续，确保离职或转让过程的合法性和合规性。
寻求专业法律支持：
- 在设立新公司和处理与原公司关系的过程中，建议您寻求专业律师的法律支持。律师可以为您提供法律咨询、起草法律文件、参与谈判等全方位的法律服务，帮助您有效避免法律风险。
三、实际操作中的注意事项
- 资金来源与财务独立：确保新公司的资金来源合法且独立于原公司，避免资金混同导致的法律风险。
- 业务区分与市场定位：明确新公司与原公司的业务区分和市场定位，避免直接竞争和利益冲突。
- 知识产权保护：若新公司涉及与原公司相同或类似的技术或产品，应加强知识产权保护，避免侵权纠纷。
总结与建议：面对与股东意见不合的情况，另起公司是一个可行的选择，但需谨慎处理与原公司的关系并采取一系列措施来避免法律风险。我建议您在决策前充分评估各种因素，并寻求专业律师的法律支持。若您有任何具体的法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问，我将竭诚为您提供帮助。