司机恶意别车并下车恐吓的行为，主要归属于公安机关交通管理部门和公安机关治安管理部门管辖，具体取决于行为的性质和后果。以下是对此问题的详细分析：

1. 恶意别车行为：

   • 管辖部门：恶意别车，即故意在道路上以不安全或挑衅的方式驾驶，阻碍其他车辆正常行驶，这种行为首先违反了交通管理法规，因此主要由公安机关交通管理部门负责处理。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，恶意别车可能构成“危险驾驶”或“妨碍安全行车”等违法行为，将受到相应的行政处罚，如罚款、扣分、吊销驾驶证等。若情节严重，还可能构成犯罪，如危险驾驶罪，将受到刑事处罚。

2. 下车恐吓行为：

   • 管辖部门：下车恐吓他人，即使用言语或行为威胁他人安全或造成他人恐惧，这种行为更侧重于治安管理方面，因此主要由公安机关治安管理部门负责处理。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国治安管理处罚法》的相关规定，恐吓他人可能构成“威胁他人人身安全”或“寻衅滋事”等违法行为，将受到行政处罚，如拘留、罚款等。若恐吓行为情节严重，造成严重后果，还可能构成犯罪，如寻衅滋事罪、敲诈勒索罪等，将受到刑事处罚。

3. 综合处理：

   • 在实际案件中，如果司机同时实施了恶意别车和下车恐吓两种行为，且这两种行为相互关联、密不可分，那么公安机关可能会根据具体情况，由交通管理部门和治安管理部门联合处理，或者根据主要行为性质确定主要管辖部门，并协调另一部门协助处理。
   • 建议：对于此类行为，受害者应及时报警，并尽可能提供详细证据，如行车记录仪视频、现场照片、证人证言等，以便公安机关能够准确判断行为性质，依法进行处理。

总结来说，司机恶意别车并下车恐吓的行为，根据其行为性质和后果，可能分别由公安机关交通管理部门和治安管理部门管辖。受害者应及时报警，并配合公安机关的调查工作，以维护自身合法权益。如果您有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。