核心结论：权利人注册了两个相同的注册商标，在面临“撤三”（即因连续三年不使用而被撤销注册商标的申请）时，需针对每个商标分别提交使用证据，且证据需满足真实性、关联性、合法性要求，具体可从以下方面着手准备和提交。
证据准备原则
- 分别准备：由于是两个独立的注册商标，即便内容相同，也需视为两个独立的法律主体进行证据准备。即，为每个商标单独整理一套完整的使用证据。
- 证据真实性：所有提交的证据必须是真实发生的，能够反映商标在实际商业活动中的使用情况，如销售合同、发票、广告宣传材料、产品包装等。
- 证据关联性：证据应直接关联到被申请撤销的商标，明确显示商标的使用时间、使用商品/服务类别、使用方式等信息。
- 证据合法性：证据的收集、制作过程需符合法律法规要求，不得侵犯他人合法权益，如不得使用伪造、变造的证据。
具体证据类型及准备要点
- 销售合同与发票：提供与商标使用相关的销售合同及对应的发票，合同中应明确标注商标名称及使用商品/服务类别，发票需与合同内容相匹配，显示商标使用情况。
- 广告宣传材料：包括但不限于报纸、杂志广告、网络广告、户外广告等，需能清晰展示商标，并注明广告发布时间、发布媒体等信息。
- 产品包装与标签：提供带有商标的产品包装照片或实物，以及产品标签，证明商标在商品上的实际使用。
- 市场调研报告：如有可能，提供第三方市场调研机构出具的关于商标使用情况的市场调研报告，作为辅助证据。
- 其他使用证据：如参加展会、举办活动的照片、视频资料，以及媒体报道等，只要能证明商标在实际商业活动中的使用，均可作为证据提交。
证据提交方式
- 书面材料：将上述证据整理成书面材料，按照商标局或审查机构的要求，编制证据清单，并附上证据复印件或扫描件。
- 电子数据：对于电子形式的证据，如网络广告截图、电子邮件等，可将其打印成纸质版或保存为电子文档，作为书面材料的补充。
- 公证与认证：对于关键证据，如涉及境外使用的证据，可考虑进行公证或认证，以增强证据的证明力。
注意事项
- 及时提交：在收到“撤三”通知后，应尽快准备并提交证据，避免因逾期提交而导致商标被撤销。
- 证据充分性：提交的证据应充分、全面，能够形成完整的证据链，证明商标在连续三年内的实际使用情况。
- 专业咨询：在准备和提交证据过程中，如有疑问或需要进一步指导，可直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业建议。
面对“撤三”申请，权利人需认真对待，为每个相同的注册商标分别准备充分、真实、关联、合法的使用证据，并按照要求及时提交，以维护自己的商标权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我提问。