针对您提出的“土地承包经营权证上的人全部消亡怎么确权”的问题，这是一个涉及土地继承与确权的复杂法律问题，需要综合考虑多种因素。以下是我为您提供的详细解答：

一、总体原则

在我国，土地使用权（包括土地承包经营权）是可以依法继承的，但具体的继承方式和程序需严格遵循相关法律法规。当土地承包经营权证上的人全部消亡时，其土地权益的转移和继承需根据土地类型、承包方式及相关法律规定来妥善处理。

二、不同类型土地的确权处理

1. 家庭承包方式取得的耕地

   • 情况分析：家庭承包地以农户家庭为单位进行承包，家庭成员之一或全部死亡不影响整体承包关系。在承包期内，若家庭成员全部消亡，该户的土地承包经营权将由发包方收回，但承包地上的收益（如农作物、林木等）可依法继承。
   • 法律依据：《中华人民共和国农村土地承包法》第十六条、第三十二条。
   • 操作建议：若家庭成员全部消亡，继承人或相关权益人应及时与发包方（如村委会）沟通，了解土地收回及收益继承的具体程序。

2. 其他方式承包的耕地（如招标、拍卖、公开协商等方式）

   • 情况分析：通过其他方式取得的耕地承包经营权，在承包人死亡后，其继承人可向发包方提出继续承包申请。若发包方同意，则办理变更手续并重新确权登记；若发包方不同意或无人继承，则土地可能被收回。
   • 法律依据：《中华人民共和国农村土地承包法》第五十四条。
   • 操作建议：继承人应尽快与发包方联系，提交相关证明材料（如承包合同、死亡证明、继承权证明等），申请继续承包或了解土地收回的具体程序。

3. 林地承包地

   • 特殊规定：林地承包地因其经营特殊性，允许继承人在承包期内继续承包。若家庭成员全部消亡，继承人可依法继承林地承包经营权，并办理相关变更登记手续。
   • 法律依据：《中华人民共和国农村土地承包法》第三十二条。
   • 操作建议：继承人应持有效证明（如承包合同、死亡证明、继承权证明等）到相关部门办理林地承包经营权变更登记手续。

4. 宅基地

   • 情况分析：宅基地使用权不能单独继承，但“地随房走”。若宅基地上有房屋，房屋继承人可继续使用相应宅基地。若宅基地上房屋已灭失且无重建，村集体有权收回宅基地。
   • 法律依据：《中华人民共和国民法典》第三百六十二条、第三百六十三条。
   • 操作建议：若宅基地上有房屋，继承人应及时办理房屋继承及宅基地使用权变更登记手续；若房屋已灭失，则无需办理确权手续，宅基地将被村集体收回。

三、特殊情况处理

1. 无继承人或继承人放弃继承

   • 若土地承包经营权证上的人全部消亡且无继承人，或继承人放弃继承，则土地将被回收归国家或集体所有。

2. 继承人非农村集体户口

   • 即使为家庭成员，若继承人非农村集体户口，也无权继承及确权土地承包经营权或宅基地使用权。土地将被村集体回收。

3. 土地争议解决

   • 若存在多个继承人争议或涉及复杂法律问题（如抵押、查封等），建议寻求专业律师帮助，通过法律途径解决争议。

四、确权程序与注意事项

1. 确权程序

   • 继承人需按照当地土地管理部门要求提交证明材料（如承包合同、死亡证明、继承权证明等）并填写申请表格。
   • 土地管理部门审核后进行实地调查，确认土地现状及继承关系。
   • 审核通过后，颁发新的土地使用权证书或办理变更登记手续。

2. 注意事项

   • 继承人应及时了解当地土地管理部门的具体要求和流程，确保提交的材料齐全、准确。
   • 在办理确权手续过程中，应保持与发包方、土地管理部门的良好沟通，及时了解处理进度和结果。
   • 若涉及法律争议或复杂情况，建议咨询专业律师以获取更详细的指导和帮助。

综上所述，当土地承包经营权证上的人全部消亡时，其土地权益的转移和继承需根据土地类型、承包方式及相关法律规定来妥善处理。继承人应及时了解相关法律法规和程序要求，确保土地权益的合法转移和继承。如有需要，请咨询当地土地管理部门或专业律师以获取更详细的指导和帮助。