针对未成年人在凌晨悄悄进入酒店的情况，酒店经营者及工作人员应当采取一系列严格且合规的措施来确保未成年人的安全，并遵守相关法律法规。以下是对此问题的详细解答：
一、酒店经营者的法定义务
根据《中华人民共和国未成年人保护法》第五十七条，旅馆、宾馆、酒店等住宿经营者在接待未成年人入住，或者接待未成年人和成年人共同入住时，有明确的法定义务：
询问与登记：应当询问父母或者其他监护人的联系方式、入住人员的身份关系等有关情况，并进行详细登记。
发现异常立即报告：如果发现有违法犯罪嫌疑，应当立即向公安机关报告，并及时联系未成年人的父母或者其他监护人。
二、未履行法定义务的后果
如果酒店经营者或工作人员未履行上述法定义务，将可能面临以下后果：
行政处罚：根据《中华人民共和国未成年人保护法》第一百二十二条，责令限期改正，给予警告；拒不改正或者造成严重后果的，责令停业整顿或者吊销营业执照、相关许可证，并处一万元以上十万元以下罚款。
刑事责任：如果因未履行报告职责造成严重后果，构成犯罪的，将依法追究刑事责任。相关单位或者单位主管人员阻止工作人员报告的，还将予以从重处罚。
三、具体处理措施
针对未成年人在凌晨悄悄进入酒店的情况，酒店应采取以下具体措施：
严格身份核验：使用人脸识别核验与人工双重确认的方式，确保入住者的身份真实有效。对于未成年人，应特别关注其是否与监护人同行，或是否持有监护人的同意入住证明。
详细询问与登记：询问未成年人的父母或其他监护人的联系方式，以及入住人员的身份关系，并进行详细登记。对于单独入住或异性混住的未成年人，应立即启动报备程序。
加强巡查与监控：酒店应加强夜间巡查，确保未成年人的安全。同时，利用监控设备对公共区域进行实时监控，以便及时发现并处理异常情况。
及时报告与联系：如果发现未成年人有异常行为或疑似遭受不法侵害，应立即向公安机关报告，并及时联系未成年人的父母或其他监护人。
四、案例警示
近年来，未成年人独自入住酒店引发的性侵、暴力、拐卖等案件屡见报端。这些案件往往暴露出酒店未严格履行登记核查义务的问题。因此，酒店必须严格执行“五必须”规定，确保未成年人的安全。同时，家长也应定期关注孩子的社交动态，告知其未经监护人同意不得擅自入住酒店。
综上所述，酒店经营者及工作人员在接待未成年人入住时，必须严格遵守相关法律法规，履行法定义务，确保未成年人的安全。对于未成年人在凌晨悄悄进入酒店的情况，酒店应采取严格身份核验、详细询问与登记、加强巡查与监控以及及时报告与联系等措施来应对。