监理单位在处理施工单位违规行为时，其“处罚”方式并非直接来源于行政处罚权，而是基于法律法规、合同约定以及行业规范与标准，通过一系列管理措施来确保工程按约进行。以下是对监理单位如何“处罚”施工单位的详细解答：
一、法律法规依据下的管理措施
《中华人民共和国建筑法》：
- 若施工单位存在偷工减料、使用不合格材料或设备、不按图纸或技术标准施工等行为，监理单位有权要求施工单位立即改正。若情节严重，监理单位可建议建设单位采取进一步措施，如停工整顿，并依据法律条款向相关部门报告，由相关部门依法进行处罚，如罚款、降低资质等级或吊销资质证书等。
《建设工程质量管理条例》：
- 对于施工单位未对材料进行检验或未对涉及结构安全的试块、试件取样检测等行为，监理单位应要求施工单位立即整改，并报告建设单位。若施工单位拒不整改或整改不到位，监理单位可依据条例规定，建议建设单位采取包括但不限于罚款、停工整顿等措施，并由相关部门依法处理。
《建设工程安全生产管理条例》：
- 若施工单位未设置安全警示标志、消防通道或配备消防设施等，监理单位应发出整改通知，要求施工单位限期改正。逾期未改正的，监理单位可建议建设单位暂停施工，并报告相关部门依法进行处罚。
二、合同约定依据下的管理措施
工程承包合同条款：
- 监理单位作为建设单位的委托代表，有权依据工程承包合同中的条款对施工单位的违约行为进行管理。例如，若施工单位因自身原因导致工期延误，监理单位可依据合同条款要求施工单位支付违约金，或采取其他合同约定的补救措施。
监理合同授权内容：
- 监理合同中通常会明确授予监理单位对工程进行监督管理的权力范围和职责。监理单位可根据合同授权，对施工单位的违规行为发出整改通知、暂停施工指令等，并要求施工单位承担相应的违约责任。
三、行业规范与标准依据下的管理措施
工程技术规范：
- 若施工单位未按照工程技术规范进行施工，导致工程质量不合格，监理单位应要求施工单位按照规范要求进行整改。对于严重违规行为，监理单位可建议建设单位采取包括但不限于扣除工程款、暂停施工等措施。
质量检验评定标准：
- 若施工单位完成的分项工程或分部工程质量经检验不符合质量检验评定标准，监理单位有权要求施工单位返工重做，并依据相关规定对其采取相应的管理措施，如扣除质量保证金、要求施工单位承担返工费用等。
四、监理单位处理违规行为的综合途径
- 监理单位在面对施工单位的违规行为时，应首先运用监理措施要求整改。若施工单位拒不整改或整改不符合要求，监理单位可通过违约索赔、建议建设单位采取进一步措施（如暂停施工、扣除工程款等）或报告相关部门依法处理等方式来维护自身和建设单位的合法权益。
总结：监理单位虽无直接行政处罚权，但通过法律法规、合同约定以及行业规范与标准，可在一定程度上对施工单位的不当行为进行约束和管理。监理单位应充分履行其监督管理职责，及时发现并纠正施工问题，确保建设工程的质量、安全和进度。同时，在处理违规行为时，应严格遵守法律法规和合同条款，确保措施的合法性和有效性。