当与公司发生纠纷并申请强制执行后，法院会依据生效法律文书（如判决书、调解书等）确定的义务内容，通过一系列法定程序和措施强制公司履行义务。具体执行方式如下：

1. 查询、冻结、划拨公司财产
   法院会首先通过执行网络查控系统，查询公司名下的银行存款、房产、车辆、股权、知识产权等财产信息。若发现可供执行的财产，法院可直接冻结公司银行账户，或对房产、车辆等财产进行查封、扣押，并通过拍卖、变卖等方式变现后清偿债务。若公司账户有存款，法院可直接划拨至申请执行人账户。

2. 限制公司高消费及非生活或经营必需消费
   若公司未履行义务，法院可将其纳入失信被执行人名单，并限制其高消费行为（如乘坐飞机、高铁、入住星级酒店等），同时禁止公司进行非生活或经营必需的消费（如购买不动产、租赁高档写字楼等），以此督促公司主动履行义务。

3. 对公司法定代表人采取限制措施
   若公司仍不履行义务，法院可对公司法定代表人采取限制高消费措施，甚至对其采取司法拘留等强制措施（如法定代表人隐匿财产、拒不配合执行等情形）。此外，若法定代表人同时为公司股东，且存在未足额出资、抽逃出资等情形，法院还可追加其为被执行人，直接执行其个人财产。

4. 对公司经营行为进行限制
   法院可向市场监管部门发送协助执行通知，禁止公司办理变更法定代表人、注销登记、股权转让等业务，防止公司通过转移资产或变更主体逃避执行。若公司涉及特定行业（如金融、建筑等），法院还可协调行业主管部门对其经营资质进行限制。

5. 对公司财产进行搜查、审计
   若法院怀疑公司隐匿财产或存在财务造假，可依法对公司经营场所进行搜查，查封、扣押相关财务资料，并委托审计机构对公司财务状况进行审计。若发现公司存在转移财产、虚假诉讼等行为，法院可依法追究公司及相关责任人的法律责任。

6. 以拒不执行判决、裁定罪追究刑事责任
   若公司有能力履行而拒不履行生效法律文书确定的义务，且情节严重（如隐藏、转移财产价值超过一定金额，或造成债权人重大损失等），法院可将案件移送公安机关立案侦查，依法追究公司及其直接负责的主管人员和其他直接责任人员的刑事责任。

温馨提示：若您已申请强制执行但公司仍未履行义务，建议及时向法院提供公司财产线索（如银行账户、房产、车辆等），并配合法院执行工作。若您对执行程序或执行措施有疑问，可直接向我咨询，我将结合您的具体情况为您详细解答。