单位不能仅因员工不能上夜班就要求其离职，这种做法是不合法的。以下从多个角度进行分析：
一、劳动合同的约定与变更
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同是劳动者与用人单位确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。劳动合同一旦签订，双方均应严格履行。如果劳动合同中明确约定了员工的工作岗位、工作时间等内容，且未包含关于上夜班的特殊要求，那么用人单位不能单方面要求员工上夜班，更不能因员工不能上夜班就要求其离职。
如果用人单位希望变更劳动合同中的工作内容（如要求员工上夜班），应当与员工进行协商，并达成一致意见。如果员工不同意变更，用人单位不能强行要求，否则可能构成违法解除劳动合同。
二、用人单位的规章制度
用人单位的规章制度应当合法、合理，且不得与法律法规相抵触。如果用人单位的规章制度中规定了员工必须上夜班，且该规定未经过民主程序制定、未向员工公示或告知，或者该规定本身违反了法律法规的强制性规定，那么该规定对员工不具有约束力。员工有权拒绝执行，用人单位也不能因此要求员工离职。
三、员工不能上夜班的合理原因
员工不能上夜班可能存在多种合理原因，如健康原因、家庭原因等。如果员工能够提供合理的证明或解释，说明其不能上夜班的原因，用人单位应当予以理解和尊重。在这种情况下，用人单位不能仅凭员工不能上夜班就要求其离职，而应当与员工协商寻找其他解决方案，如调整工作岗位、工作时间等。
四、用人单位违法解除劳动合同的法律后果
如果用人单位违法解除劳动合同，根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，员工有权要求用人单位继续履行劳动合同或者支付赔偿金。赔偿金的计算标准通常为经济补偿标准的二倍，经济补偿则根据员工在用人单位的工作年限和月工资等因素确定。
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