长期组织货运超载运输，在一般情况下属于行政违法，但当情节严重时，可能构成刑事犯罪。以下是对这一问题的详细分析：
一、一般超载行为的法律性质及后果
法律性质：
- 货运机动车超过核定载质量进行运输，通常被视为行政违法行为。
法律后果：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十二条的规定，货运机动车超过核定载质量的，将面临二百元以上五百元以下的罚款；若超过核定载质量百分之三十或者违反规定载客的，则处五百元以上二千元以下罚款。
- 同时，公安机关交通管理部门有权扣留机动车至违法状态消除，即要求驾驶人卸载超载的货物，费用由超载机动车的驾驶人或者所有人承担。
二、严重超载行为的法律性质及后果
法律性质：
- 当货运超载行为达到严重程度，特别是经交通运输管理部门责令整改后，仍拒绝执行继续超载运输，且情节严重时，可能构成刑事犯罪。
法律后果：
- 妨害公务罪：根据《中华人民共和国刑法》第二百七十七条的规定，以暴力、威胁方法阻碍国家机关工作人员依法执行职务的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者罚金。虽然该条款未直接提及超载，但若货运车辆在超载情况下拒绝执行交通运输管理部门的整改要求，并采取暴力、威胁方法阻碍执法，则可能构成此罪。不过，更常见的是，货运车辆因长期超载且拒不改正，被认定为情节严重，从而涉嫌构成妨害公务罪的其他情形。
- 其他相关犯罪：虽然直接针对货运超载的刑事犯罪条款较少，但若超载行为导致交通事故，且驾驶人负事故主要或全部责任，造成严重后果的，还可能构成交通肇事罪等其他犯罪。此外，如果超载运输的是危险化学品，且危及公共安全，还可能构成危险驾驶罪中的相关情形。
三、实际应用中的建议
严格遵守交通规则：
- 货运企业和驾驶人应严格遵守交通规则，确保货运机动车不超载运输，以免面临行政处罚或刑事责任。
积极配合整改要求：
- 在遇到交通运输管理部门的整改要求时，货运企业和驾驶人应积极配合，及时卸载超载货物，避免事态升级至刑事层面。
增强交通安全意识：
- 货运企业和驾驶人应增强交通安全意识，认识到超载运输的危害性，共同维护道路交通秩序和安全。
总结来说，长期组织货运超载运输在一般情况下属于行政违法，但当情节严重时，可能构成刑事犯罪。因此，货运企业和驾驶人应严格遵守交通规则，积极配合整改要求，增强交通安全意识，以避免法律风险。如果您有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。