结论：妻子在实习期驾驶老公的车辆，若因交通违法行为被扣分，一般情况下，扣分将直接记在驾驶人（即妻子）的驾驶证上，而非车主（老公）的驾驶证上。但具体处理还需根据违法行为的性质、地方交通管理规定以及是否存在特殊情况来综合判断。以下从多个角度进行分析：

一、一般情况下的扣分处理

1. 扣分原则：根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，交通违法行为的扣分是针对驾驶人的，而非车辆所有人。因此，如果妻子在实习期驾驶老公的车辆违反了交通规则，扣分将直接记在妻子的驾驶证上。

2. 实习期特殊规定：实习期内的驾驶人需要遵守更为严格的交通规则，如实习期不得单独驾驶高速公路（除非有相应或更高准驾车型驾驶证三年以上的驾驶人陪同）、粘贴实习标志等。若违反这些规定，除了可能面临罚款外，还可能被延长实习期或注销驾驶证。但这些处罚同样直接针对驾驶人，而非车辆所有人。

二、特殊情况下的扣分处理

1. 车辆所有人与驾驶人责任分离：在大多数情况下，车辆所有人的责任与驾驶人的责任是分离的。即，车辆所有人（老公）不需要因为驾驶人（妻子）的违法行为而承担扣分责任。但是，如果车辆所有人存在指使、强令驾驶人违法驾驶等行为，可能会面临相应的法律责任。

2. 地方交通管理规定：不同地区的交通管理规定可能存在差异。有些地方可能对实习期驾驶人有更为严格的管理措施，或者对特定违法行为有特殊的处理方式。因此，在处理此类问题时，还需要考虑当地的具体规定。

三、建议与措施

1. 了解当地规定：建议妻子和老公先了解当地交通管理部门对实习期驾驶人的具体规定，以及交通违法行为的处理方式。这有助于他们更好地遵守交通规则，避免不必要的麻烦。

2. 及时处理违法行为：如果妻子确实因交通违法行为被扣分，应及时到交通管理部门接受处理，并按照规定缴纳罚款。拖延处理可能会导致更严重的后果，如驾驶证被暂扣或吊销等。

3. 加强交通安全教育：作为车辆所有人和驾驶人的家属，老公有责任和义务对妻子进行交通安全教育，提醒她遵守交通规则，确保行车安全。

4. 咨询专业律师：如果对交通违法行为的处理存在疑问或争议，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见和帮助。

最后，希望以上分析能对您有所帮助。如果您在劳动纠纷或经济纠纷方面有任何法律问题，也可以直接向我咨询，我会尽我所能为您提供专业的法律帮助。