自然人与政府之间借款的诉讼时效问题，核心在于明确诉讼时效的期间、起算点以及可能的中断、中止情形。以下是对这一问题的详细解答：

一、诉讼时效期间

根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。这一规定同样适用于自然人与政府之间的借款纠纷。也就是说，如果自然人认为政府未按照约定履行还款义务，其有权在知道或应当知道权利受到损害之日起三年内，向人民法院提起诉讼。

二、诉讼时效起算点

诉讼时效的起算点通常是从权利人知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。在自然人与政府的借款纠纷中，这通常意味着：

1. 借款到期日：如果借款合同中明确约定了还款期限，那么诉讼时效通常从还款期限届满之日起计算。
2. 无固定期限借款：如果借款合同未约定还款期限，或者约定不明确，那么诉讼时效的起算点可能需要根据具体情况来确定，如从自然人向政府催讨借款之日起计算，或者从政府明确表示拒绝还款之日起计算。

三、诉讼时效的中断与中止

在诉讼时效期间内，如果发生某些法定事由，可能会导致诉讼时效的中断或中止。

1. 诉讼时效中断：根据《民法典》第一百九十五条的规定，权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务、权利人提起诉讼或者申请仲裁等情形，都会导致诉讼时效的中断。中断后，诉讼时效期间重新计算。在自然人与政府的借款纠纷中，如果自然人向政府催讨借款，或者政府表示愿意还款，都可能导致诉讼时效的中断。
2. 诉讼时效中止：根据《民法典》第一百九十四条的规定，在诉讼时效期间的最后六个月内，因不可抗力或者其他障碍不能行使请求权的，诉讼时效中止。中止时效的原因消除之日起满六个月，诉讼时效期间届满。在自然人与政府的借款纠纷中，如果因自然灾害、战争等不可抗力因素导致自然人无法行使请求权，或者政府因特殊原因（如政府机构改革、人员变动等）导致无法履行还款义务，都可能导致诉讼时效的中止。

四、特殊情况下的诉讼时效

在某些特殊情况下，诉讼时效可能不受三年期间的限制。例如，如果政府作为债务人，其借款行为涉嫌违法或犯罪（如贪污、挪用公款等），那么自然人可能不受诉讼时效的限制，可以随时向有关部门举报或提起诉讼。但这种情况较为特殊，需要具体问题具体分析。

五、建议与提醒

1. 及时行使权利：自然人在发现政府未按照约定履行还款义务时，应及时向政府催讨借款，并保留好相关证据（如催讨记录、借款合同等），以避免诉讼时效过期。
2. 咨询专业律师：如果自然人对诉讼时效问题存在疑问或担忧，建议及时咨询专业律师，以便更好地了解自己的权利和义务，并制定合适的维权策略。

总之，自然人与政府之间借款的诉讼时效问题涉及多个方面，包括诉讼时效期间、起算点、中断与中止以及特殊情况下的诉讼时效等。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。