代持法人即便有免责协议，在特定情况下仍然可以起诉实际控制人要求变更法定代表人。以下从不同角度为您详细分析：
一、免责协议的法律效力与限制
免责协议，如果其内容合法且不违反公序良俗，通常在双方当事人之间具有法律约束力。然而，这种协议并不能完全免除法定代表人因公司行为而可能承担的法律责任，特别是在涉及外部第三方权益或违反法律法规的情况下。例如，如果公司存在违法行为，法定代表人作为公司的代表，可能仍需承担相应的法律责任，免责协议不能成为其逃避法律责任的“护身符”。
二、起诉实际控制人变更法定代表人的法律依据
《公司法》的相关规定：
- 根据《公司法》第十三条，公司法定代表人依照公司章程的规定，由董事长、执行董事或者经理担任，并依法登记。公司法定代表人变更，应当办理变更登记。
- 如果实际控制人未经合法程序擅自变更法定代表人，或者利用其控制地位迫使原法定代表人继续担任该职务，原法定代表人有权依据《公司法》的相关规定，要求实际控制人停止侵权行为，并恢复其合法权益，包括变更法定代表人登记。
《民法典》中关于代理与委托的规定：
- 如果代持法人的关系是基于委托合同而建立的，那么根据《民法典》中关于委托合同的规定，委托人（即实际控制人）应当按照委托人的指示处理委托事务。如果委托人未经同意擅自变更委托事项（如变更法定代表人），受托人（即代持法人）有权要求委托人承担违约责任，并恢复原状。
三、实际操作中的考虑因素
免责协议的具体内容：
- 需要仔细审查免责协议的具体条款，确定其是否涵盖了法定代表人变更这一事项，以及是否明确约定了在此情况下的权利义务关系。
实际控制人的行为性质：
- 需要评估实际控制人变更法定代表人的行为是否合法、合规，以及是否存在滥用控制权、损害公司或其他股东利益的情况。
证据收集与诉讼策略：
- 在起诉前，需要收集充分的证据来证明实际控制人的不当行为，以及自己因此遭受的损失。同时，还需要制定合理的诉讼策略，以确保诉讼的顺利进行和胜诉的可能性。
四、可能的法律后果
- 如果法院认定实际控制人确实存在不当行为，且免责协议不能成为其逃避法律责任的依据，那么法院可能会支持代持法人的诉讼请求，要求实际控制人变更法定代表人登记，并可能承担因此产生的相关费用。
- 反之，如果法院认为免责协议合法有效，且实际控制人的行为并未违反法律法规或公司章程的规定，那么代持法人的诉讼请求可能会被驳回。
建议：如果您作为代持法人面临此类情况，建议您首先仔细审查免责协议的具体内容，并收集相关证据来证明实际控制人的不当行为。然后，您可以考虑咨询专业律师（即我本人，陈晓辉律师，专注于公司事务、股权转让领域），以制定合理的诉讼策略并维护自己的合法权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。