在交通事故中若同时遭遇医疗事故，并已经自行鉴定为医疗事故，那么接下来的赔偿流程可以遵循以下步骤进行：
一、确认医疗事故鉴定结果
首先，确保你的医疗事故鉴定是由专门机构，如医学会，进行的医疗事故技术鉴定，并且该鉴定结果已经明确确认了医疗事故的性质和责任。这是后续处理的基础，也是要求赔偿的重要依据。
二、选择赔偿解决途径
自行协商：
- 你可以与医疗机构自主自愿进行协商，就赔偿等民事责任争议达成一致意见。
- 协商过程中，建议签订一份详细的协议书，明确双方当事人基本情况、医疗事故原因、等级及赔偿数额，并由双方签名确认，以避免后续纠纷。
行政调解：
- 如果自行协商无果，你可以向卫生行政部门申请调解。行政部门将遵循自愿原则进行调解，并计算赔偿数额。
- 调解成功则制作调解书，双方应履行；调解不成或一方反悔，你可以向人民法院提起民事诉讼。
人民调解：
- 你还可以向人民调解委员会申请调解，委员会将组织专家进行调解，以达成调解协议。
法律途径：
- 若协商、行政调解和人民调解均无法解决争议，你可以向有管辖权的人民法院提起民事诉讼。
- 在诉讼过程中，你需要承担举证责任，证明医疗行为存在过错、损害后果及二者之间的因果关系。法院将依据双方提供的证据进行审理，并依法作出判决。
三、赔偿项目与标准
- 如果法院判决医疗机构承担赔偿责任，赔偿项目可能涵盖医疗费、误工费、住院伙食补助费、陪护费、残疾生活补助费、残疾用具费、丧葬费、被扶养人生活费、交通费、住宿费、精神损害抚慰金等。具体赔偿标准将依据相关法律法规和实际情况进行确定。
四、其他注意事项
- 在处理医疗事故赔偿过程中，保持冷静和理性，避免情绪化行为。
- 保留好所有相关证据，包括医疗事故鉴定报告、医疗记录、费用单据等，以备不时之需。
- 如果对医疗事故鉴定结果有异议，可以依法申请重新鉴定或寻求其他法律途径解决。
总结：
在交通事故中遭遇医疗事故并已经自行鉴定为医疗事故后，你可以通过自行协商、行政调解、人民调解或法律途径等解决赔偿争议。在处理过程中，务必保持冷静和理性，保留好相关证据，并依据相关法律法规和实际情况来维护自己的合法权益。