两个被告共同负担案件受理费时，区分金额的方式主要依据法院判决或调解书中确定的各自承担比例或具体数额。具体来说，有以下几种情况：

1. 按比例分担：如果法院判决或调解书中明确规定了两个被告各自应承担的案件受理费比例，那么就按照这个比例来区分金额。例如，判决书中可能写明“被告A承担60%的案件受理费，被告B承担40%的案件受理费”，那么就按照这个比例来计算各自应支付的金额。

2. 按具体数额分担：有时候，法院判决或调解书可能会直接规定两个被告各自应承担的案件受理费具体数额。这种情况下，直接按照判决书或调解书中写明的数额来支付即可。例如，判决书中可能写明“被告A承担案件受理费5000元，被告B承担案件受理费3000元”。

3. 连带责任下的分担：如果两个被告对案件受理费承担连带责任，那么在实际执行过程中，可能会先由其中一个被告承担全部费用，然后再根据内部约定或法院进一步判决来确定两个被告之间的分担比例。不过，这种情况相对较少见，且通常会在判决书中明确说明。

在处理共同负担案件受理费的问题时，建议注意以下几点：

• 仔细阅读法院判决或调解书，明确各自应承担的费用比例或数额。
• 如果对判决或调解书中的费用分担有疑问或异议，应及时向法院提出，以便及时澄清或调整。
• 在实际支付费用时，应按照判决或调解书的要求及时履行，避免因拖延或拒付而产生不必要的法律纠纷。

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