核心结论：购买回迁房仅有协议书且无法过户时，需根据协议效力、卖方配合意愿、政策限制等因素综合处理，可通过法律途径确认产权归属或主张违约赔偿。以下是具体分析：

一、协议书的法律效力是关键前提

1. 有效协议的约束力
   若协议书内容合法（如双方具备民事行为能力、意思表示真实、不违反法律强制性规定），即使未过户，协议仍对双方具有约束力。根据《民法典》第215条，未办理物权登记不影响合同效力，买方可依据协议主张卖方履行过户义务或赔偿损失。

2. 无效协议的风险
   若协议存在瑕疵（如卖方无权处分、违反“一房多卖”禁止性规定），可能被认定无效。此时需根据过错责任分担损失，例如卖方故意隐瞒房屋权属问题，需承担主要赔偿责任。

二、无法过户的常见原因及应对方案

1. 卖方不配合过户

   • 法律途径：向法院起诉要求卖方继续履行合同，配合办理过户手续。若卖方拒不执行，可申请强制执行。
     
   • 风险点：若房屋已被抵押或查封，即使胜诉也可能无法过户，此时可主张解除合同并要求赔偿。

2. 政策限制导致无法过户

   • 回迁房交易限制：部分地区规定回迁房需满足一定年限（如5年）才能上市交易，或需补缴土地出让金。若因政策原因暂时无法过户，可要求卖方在政策允许后立即配合办理。
     
   • 解决方案：在协议中明确约定政策风险承担条款（如“若因政策原因无法过户，卖方需退还房款并赔偿利息”），以降低自身风险。

3. 房屋权属存在争议

   • 查清权属：通过不动产登记中心查询房屋权属状态，确认是否存在共有权人、继承纠纷等问题。
     
   • 追加当事人：若房屋涉及其他权利人（如配偶、子女），需追加为共同被告或第三人，确保协议效力覆盖所有权利人。

三、实务建议：降低风险的预防措施

1. 完善协议条款

   • 明确约定过户时间、违约责任（如逾期过户每日按房款万分之五支付违约金）、政策风险承担等条款，增强协议可执行性。
     
   • 示例条款：“若因卖方原因导致无法过户，买方有权解除合同，卖方需退还全部房款并支付房款20%的违约金。”

2. 办理预告登记

   • 若当地允许，可办理房屋预告登记，防止卖方“一房多卖”或擅自处分房屋。根据《民法典》第221条，预告登记后，未经买方同意，卖方处分房屋的行为不发生物权效力。

3. 留存付款凭证

   • 保存转账记录、收据等付款证据，证明已履行合同义务。若发生纠纷，这些证据是主张权利的关键。

四、特殊情形：小产权房的风险提示

若回迁房属于“小产权房”（未取得合法产权证书），即使签订协议也无法过户，且交易本身不受法律保护。此时需谨慎评估风险，避免因房屋被拆迁、没收导致血本无归。

总结：购买回迁房时，协议书是重要依据，但需结合房屋权属、政策限制等因素综合判断。若无法过户，建议优先通过协商或法律途径解决，并在协议中明确风险承担条款。如有具体协议内容或房屋情况，可进一步向我咨询，我会结合细节提供针对性建议。