在鉴定质证阶段，是否已经确定鉴定机构需分情况讨论：

1. 若案件已进入鉴定程序且完成鉴定机构选定
   在鉴定质证阶段，通常已通过法定程序（如双方协商、法院指定或摇号等方式）确定了鉴定机构。此时质证的核心是围绕该机构出具的鉴定意见进行审查，包括鉴定资质、程序合法性、方法科学性等。例如，在医疗纠纷中，若双方已共同委托某司法鉴定中心进行伤残等级鉴定，质证时需重点审查该中心是否具备相应资质、鉴定过程是否符合规范。

2. 若案件尚未完成鉴定机构选定
   若案件处于鉴定启动阶段但未确定机构，质证阶段可能涉及对鉴定机构选择程序的合法性进行审查。例如，一方当事人对法院摇号选定的机构提出异议，认为其存在利益关联或专业领域不匹配，此时需通过质证程序决定是否重新选定机构。

3. 特殊情形下的机构确定规则

   • 诉前鉴定：若当事人在起诉前自行委托鉴定，质证时对方可能以“未共同选定机构”为由质疑鉴定效力，此时需结合《民事证据规定》第41条，审查对方是否在举证期限内申请重新鉴定。
     
   • 补充鉴定/重新鉴定：若原鉴定机构被撤销或鉴定人回避，需通过质证程序确定新的鉴定机构，此时需重点审查新机构的资质与独立性。

实务建议：

• 若您是质证方，需提前调取鉴定机构资质证书、鉴定人执业资格等材料，审查其是否列入《国家司法鉴定人和司法鉴定机构名册》；
  
• 若对机构选定程序有异议，应在收到鉴定意见后10日内提出书面申请，并附具体理由及证据；
  
• 涉及专门性问题的鉴定（如工程造价、知识产权），需确认机构是否具备对应领域的专业资质。

如有具体案件背景，可进一步向我说明，我将结合《民事诉讼法》第81条、《司法鉴定程序通则》等规定为您分析。