公司有违法行为时，其法人（法定代表人）是否需承担责任，需根据具体情况及法律规定来综合分析，并非一概而论。以下是对此问题的全面阐述：
一、公司独立承担责任原则
- 公司责任：
- 根据《中华人民共和国民法典》第六十一条，法定代表人以法人名义从事的民事活动，法律后果由法人承受。一般情况下，公司违法行为的责任由公司以其全部财产独立承担。例如，公司因排放超标污染物被环保部门处罚，该责任通常由公司承担，不直接追究法定代表人个人责任。
二、法定代表人需承担责任的情形
过错追偿责任：
- 依据《中华人民共和国民法典》第六十二条，若法定代表人在执行职务过程中有过错，导致公司承担民事责任后，公司可依法向有过错的法定代表人追偿。比如，法定代表人未经充分市场调研盲目决策，导致公司签订不利合同并遭受损失，公司有权向其追偿。
关联违法行为责任：
- 根据《中华人民共和国公司法》第二十一条，公司股东滥用股东权利给公司或者其他股东造成损失的，应当承担赔偿责任。若法定代表人是相关股东且存在此类行为，则应承担相应责任。同时，《中华人民共和国公司法》第二十三条规定，公司股东滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，严重损害公司债权人利益的，应当对公司债务承担连带责任。若法定代表人与这些滥用行为有关联，也可能需要承担责任。例如，法定代表人通过关联交易掏空公司资产，损害债权人利益，将可能被要求承担连带责任。
特定领域法律责任：
- 在某些特定领域，如税收征管中，若公司存在偷税漏税行为，且法定代表人起主要作用，则可能面临行政处罚甚至刑事责任。《中华人民共和国税收征收管理法》对此有明确规定。比如，法定代表人指使财务人员伪造账簿、隐瞒收入以逃避纳税，将可能被税务机关处以罚款，并可能因涉嫌逃税罪被追究刑事责任。
三、责任类型与承担方式
民事责任：
- 公司违法行为导致他人受损时，公司需承担赔偿责任。在法人人格否认等特殊情况下，法定代表人也可能需与企业对外承担连带民事责任。例如，公司因产品质量问题导致消费者受损，公司需赔偿消费者损失；若法定代表人明知产品质量存在问题仍指示销售，且公司财产不足以赔偿时，法定代表人可能需承担连带赔偿责任。
行政责任：
- 对于公司的非法经营、抽逃资金等行为，法定代表人可能会面临罚款等行政处分。法院可直接对其进行罚款，并可向有关部门提出司法建议进一步追究。比如，公司未按规定办理税务登记或纳税申报，税务机关可对公司处以罚款，并可能对法定代表人处以个人罚款或行政处分。
刑事责任：
- 若公司行为触犯刑法，如法人犯罪，且法定代表人被认定有直接责任或过失，则可能受到刑事处分，包括判刑等。例如，公司实施非法吸收公众存款罪，法定代表人作为主要负责人，若被认定有直接责任，将可能被追究刑事责任。
四、综合分析与建议
- 公司作为一个独立的法律主体，其违法行为首先应由公司本身承担法律责任。但在特定情况下，法定代表人作为直接负责人员或其他责任人员，可能面临相应的处罚。
- 法定代表人应严格遵守法律法规，确保公司合法合规经营，并建立健全内部管理制度以防范违法行为。例如，定期组织员工进行法律培训、建立合规审查机制等。
- 面对公司违法问题，法定代表人应积极配合调查处理，并根据实际情况承担相应的法律责任。若认为自身无过错或责任较轻，可积极收集证据以证明自身清白或减轻责任。
综上所述，公司有违法行为时，其责任承担需根据具体情况和法律规定来确定。法定代表人虽不总是直接承担责任，但在特定情形下仍需对公司的违法行为负责。因此，作为公司的法定代表人，应时刻保持警惕，确保公司运营符合法律法规要求。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。