申请二次鉴定时，鉴定机构不受理的原因可能包括以下几点：

1. 材料问题：

   • 分析：鉴定材料是鉴定工作的基础，若材料不完整、不真实或与鉴定事项无关，鉴定机构将无法准确进行鉴定。例如，在人身伤害伤残鉴定中，若缺少关键的病历资料、影像片等，鉴定机构会因无法判断伤情和伤残等级而拒绝受理。
   • 建议：仔细查看鉴定机构给出的不予受理通知书，明确指出的材料问题，并按照要求补充完整、真实的鉴定材料，确保材料与鉴定事项紧密相关。

2. 管辖问题：

   • 分析：每个司法鉴定机构都有其特定的管辖范围和业务范围。若案件不属于该机构的管辖范围，或者超出了其业务能力，鉴定机构会拒绝受理。例如，某些特殊的物证鉴定可能只有省级以上的专业鉴定机构才有资质进行。
   • 建议：了解不同鉴定机构的管辖范围和业务能力，选择有管辖权且具备相应资质的鉴定机构重新申请鉴定。可以通过当地司法行政部门、行业协会等渠道获取相关信息。

3. 鉴定用途不合法或违背公序良俗：

   • 分析：鉴定结果不能被用于违法犯罪活动，也不能违背社会公共秩序和善良风俗。若鉴定用途不合法或违背公序良俗，如为制造虚假保险理赔案件而进行的伤残鉴定，或代孕相关的亲子关系鉴定，鉴定机构会拒绝受理。
   • 建议：确保鉴定用途合法且符合公序良俗，避免涉及违法或违背道德伦理的鉴定事项。

4. 鉴定要求不符合执业规则或技术规范：

   • 分析：司法鉴定遵循严格的执业规则和技术规范。若委托方的鉴定要求不符合这些规定，如采用被淘汰的检测方法进行血液酒精含量鉴定，鉴定机构会拒绝受理。
   • 建议：了解并遵守司法鉴定的执业规则和技术规范，确保鉴定要求符合相关规定。

5. 超出技术条件或鉴定能力：

   • 分析：每个司法鉴定机构的技术设备和人员专业水平有限。若委托事项超出机构的技术条件或鉴定能力，如复杂的基因鉴定项目需要高精度设备和专业团队而机构不具备，鉴定机构会拒绝受理。
   • 建议：在选择鉴定机构时，考虑其技术条件和鉴定能力，确保机构能够胜任委托事项。

6. 委托书问题：

   • 分析：委托人必须提供合法、有效的司法鉴定委托书。若委托书不合法、无效或对鉴定机构的约束明显有失公平，鉴定机构有权拒绝受理。
   • 建议：确保委托书的合法性和有效性，避免因委托书问题导致鉴定机构拒绝受理。

7. 其他法定情形：

   • 分析：根据相关法律法规和鉴定规范，还存在一些其他法定不受理的情形，如委托事项超出本机构司法鉴定业务范围的、鉴定要求不符合司法鉴定执业规则或者相关鉴定规范的等。
   • 建议：认真研读相关法律法规和鉴定规范，确认自己的委托事项是否符合规定。如果不符合，需要调整委托事项或寻找其他合法合规的途径解决问题。

若鉴定机构不受理，您可以采取以下措施：

• 与鉴定机构沟通协商：以诚恳、理性的态度与鉴定机构的工作人员进行沟通，说明自己的情况和需求，听取他们的解释和建议。尝试提供额外的信息或材料，以证明案件的合理性和可行性。
• 寻求上级指导或监督：若认为鉴定机构的不受理决定不合理或存在违规行为，可以向当地的司法行政部门反映情况。司法行政部门负责对司法鉴定机构进行监督和管理，有权对鉴定机构的行为进行调查和处理。同时，也可以申请司法鉴定行业协会进行调解。
• 法律途径解决：若对司法行政部门或其他相关行政机关的处理结果不满意，还可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自己的合法权益。

在处理此类问题时，建议您保持冷静和理性，按照法律程序和规定进行操作。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。