签协议用别名通常无效，但在特定情况下可能有效。以下是对这一问题的详细分析：
一、一般情况下的无效性
合同主体不符：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在合同上签署别名，若该别名并非签字人的真实姓名，且未得到真实姓名所有者的授权，则表明签字人并非合同的真实缔约方。这违反了合同的基本要素——合同主体的真实性，因此，从法律上讲，这样的合同是无效的。
冒用行为违法：
- 未经他人同意擅自使用其姓名（包括别名，若该别名被他人专属使用且具有识别性）进行签约，属于冒用他人身份的行为，侵犯了他人的姓名权。这种行为不仅违反了法律规定，也违背了基本的商业道德和诚信原则。
无法履行义务：
- 由于签字人并非合同约定的权利义务承受者，当需要履行合同义务或追究违约责任时，往往会出现无法找到责任主体的情况，导致合同目的无法实现。
二、特殊情况下的有效性
代理关系存在：
- 如果签字人是经过被代理人合法授权的代理人，并且在其授权范围内代表被代理人签订合同，那么该合同对被代理人具有约束力。这种情况下，虽然签字人可能使用了别名或非真实姓名，但因其具备合法的代理资格，所签合同仍然有效。不过，为了证明代理关系的存在，通常需要提供授权委托书等证明材料。
表见代理情形：
- 在某些特殊情况下，即使签字人没有实际的代理权，但如果相对人有理由相信其有代理权（如持有被代理人的介绍信、盖有公章或合同专用章的空白合同书等），并基于这种信赖与其签订了合同，那么该合同也可能被视为有效。这种情况下，为了保护善意相对人的利益，维护交易安全，法律会认定合同有效。但这种情况下的有效性认定较为复杂，需要具体分析相关证据和事实。
法律建议
- 避免使用别名签约：为了确保合同的有效性和避免不必要的法律纠纷，建议当事人在签订合同时使用真实姓名或经过合法授权的代理人的姓名。
- 明确代理关系：如果确实需要代理人代为签约，应确保代理人具备合法的代理资格，并在合同中明确代理关系和代理权限。
- 保留相关证据：在签约过程中，应保留好相关证据，如授权委托书、介绍信等，以证明签约行为的合法性和有效性。
如果您在签订协议时遇到了使用别名或相关代理问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。