外资参股企业在中国运营时，确实需要适用《中华人民共和国公司法》（以下简称“《公司法》”），但同时也需遵循《中华人民共和国外商投资法》（以下简称“《外商投资法》”）等相关法律法规。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与一般适用规则
《公司法》的适用性：
- 根据《公司法》第二条的规定，公司是指依照本法在中国境内设立的有限责任公司和股份有限公司。外资参股企业，作为在中国境内设立的公司形式，其设立、变更、解散等程序，以及组织机构（如股东会、董事会、监事会）的设立和运作，均应遵循《公司法》的相关规定。
- 例如，外资参股的有限责任公司，其股东出资方式、注册资本的确定与变更、股东会的召集程序与表决机制等，都必须符合《公司法》对于有限责任公司的具体要求。
《外商投资法》的特别规定：
- 《外商投资法》第三十一条明确规定，外商投资企业的组织形式、组织机构及其活动准则，适用《公司法》、《中华人民共和国合伙企业法》等法律的规定。这进一步确认了外资参股企业在组织形式和组织机构上应遵守《公司法》的相关规定。
- 同时，《外商投资法》及其配套规定还对外商投资企业的设立条件、投资领域、优惠政策、信息报告义务等方面作出了详细规范，是确保外商投资活动合法合规的重要依据。
二、特殊过渡规定与考虑因素
过渡期安排：
- 对于在《外商投资法》施行前依据“外资三法”（《中华人民共和国中外合资经营企业法》、《中华人民共和国外资企业法》、《中华人民共和国中外合作经营企业法》）已设立的外资参股企业，存在五年的过渡期安排。在这五年内，这类企业可以继续保留原有的企业组织形式和按照原“外资三法”制定的企业章程进行运营管理。
- 然而，过渡期结束后，这些企业必须全面调整以符合《公司法》及其他相关法律法规的最新要求。
特别法优先原则：
- 当《公司法》的一般性规定与《外商投资法》及其配套规定等特别法的规定不一致时，应依据“特别法优于一般法”的原则，优先适用特别法的规定。例如，在投资比例、注册资本、合营期限等方面，若《外商投资法》有特别规定，则应优先适用。
三、实践指导与法律建议
完善公司治理结构：
- 外资参股企业应根据《公司法》的要求，完善公司治理结构，明确股东、董事会、监事会的职责与权限，保障投资者的合法权益。
建立健全内部管理制度：
- 外资参股企业应建立健全内部管理制度，确保公司的财务、会计、信息披露等方面的合法合规性，促进企业的健康发展。
密切关注法律法规更新：
- 外资参股企业应密切关注相关法律法规的更新与变化，及时调整企业经营策略与管理措施，以适应不断变化的法律环境。例如，随着《外商投资法》的施行，外资参股企业需及时调整其组织形式和组织机构，以符合新的法律要求。
总结来说，外资参股企业在中国运营时，既需遵循《公司法》的一般性规定，也需特别遵守《外商投资法》及其配套规定等特别法的具体要求。在实际操作中，外资参股企业应综合考虑这两部法律及其相关法规的要求，确保企业的合法合规经营与稳健发展。如有任何疑问或需要进一步的法律指导，请直接向我咨询。