结论：网贷借5000元，6年后还10000元，是否合法需根据具体情况判断，主要取决于借款时的利率约定是否超过法律规定的上限。

分析说明：

1. 利率合法性判断：

   • 根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》，借贷双方约定的利率未超过合同成立时一年期贷款市场报价利率（LPR）的四倍，出借人请求借款人按照约定的利率支付利息的，人民法院应予支持。
   • 若借款时约定的利率超过了上述标准，则超过部分的利息约定无效，借款人无需支付。

2. 具体计算与判断：

   • 假设借款时的一年期LPR为X%，则合法利率上限为4X%。
   • 6年的总利息若按合法上限计算，应为：\(5000 \times 4X\% \times 6\)（这里X%需替换为实际的LPR数值）。
   • 若实际约定的利息（即10000元-5000元=5000元利息）超过了上述计算出的合法利息上限，则超出部分不合法。
   • 计算公式：合法利息上限 = \(借款本金 \times 4 \times 借款时一年期LPR \times 借款年数\)。将具体数值代入公式即可计算出合法利息上限，再与实际利息进行比较。

3. 实际案例判断：

   • 由于未给出具体的借款时间（即LPR的具体数值），无法直接计算出合法利息上限。但可以根据一般经验进行大致判断：若6年的总利息5000元相对于本金5000元来说过高，很可能超过了法律规定的上限。
   • 例如，若借款时一年期LPR为4%，则合法利息上限为\(5000 \times 4 \times 4\% \times 6 = 4800\)元。此时，实际约定的10000元还款中，有5200元（10000-4800）为不合法利息。

行动建议：

• 核实借款合同：首先，应仔细审查借款合同，明确借款时的利率约定。
• 计算合法利息：根据借款时的LPR数值，使用上述公式计算出合法利息上限。
• 协商或诉讼：若实际利息超过了合法上限，可以与出借人协商降低利息；若协商不成，可以向人民法院提起诉讼，请求确认超出部分的利息无效。

法律后果：

• 若出借人要求支付的利息超过了法律规定的上限，借款人有权拒绝支付超出部分的利息。
• 若出借人因此提起诉讼，人民法院将根据法律规定，判决借款人只需支付合法范围内的利息。

如有更多细节或疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。