结论：夫妻一方有刑事案件，另一方能否选村党支部书记需分情况讨论，主要取决于另一方是否自身存在影响选举资格的情形，以及该刑事案件是否对另一方的政治权利、社会评价等造成实质性影响。

1. 若另一方自身无违法犯罪记录，且未因配偶的刑事案件受到牵连或影响，一般可以参选村党支部书记
   根据《中国共产党基层组织选举工作条例》及《村民委员会组织法》，村党支部书记的选举资格主要考察候选人本人的政治素质、道德品行、能力水平等，而非其配偶的违法犯罪记录。若另一方未因配偶的案件被追究法律责任（如未被认定为共同犯罪、未被采取强制措施等），且其本人符合党员条件（如未被开除党籍、未受留党察看处分等），理论上可以参选。
   例外情形：若配偶的刑事案件涉及危害国家安全、严重暴力犯罪等，可能引发社会对另一方政治立场的质疑，但法律上仍以本人行为为准，除非组织认定其存在“政治问题”或“社会影响恶劣”等情形。

2. 若另一方因配偶的刑事案件被牵连，或自身存在影响选举资格的情形，则不能参选

   • 法律层面：若另一方因配偶的案件被认定为共同犯罪、包庇犯罪等，被依法追究刑事责任或受到行政处罚（如拘留、罚款等），根据《中国共产党纪律处分条例》或《村民委员会组织法》，其可能被取消党员资格或选举资格。
     
   • 纪律层面：若另一方作为党员，未主动报告配偶的刑事案件，或存在隐瞒、包庇等行为，可能被认定为违反组织纪律，受到党纪处分，进而影响参选资格。
     
   • 社会评价层面：若配偶的案件导致另一方在村民中声誉受损（如涉及贪污、腐败等），可能因“群众基础差”被否决参选资格，但这一情形需结合具体选举规则判断。

3. 特殊情形：配偶的刑事案件是否涉及“村干部任职资格限制”
   若配偶的刑事案件与村务管理相关（如贪污村集体财产、挪用公款等），另一方作为近亲属可能被组织重点审查。但法律未明确规定“配偶有刑事案件即禁止另一方参选”，仍需以本人是否符合条件为准。

建议：若您或您的家人面临此类情况，建议提前梳理自身是否符合参选条件（如党员身份、无违法记录等），并主动向组织说明配偶案件情况，避免因信息不透明影响选举结果。如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我会结合法律条文和实务经验为您分析。