公司二次绩效考核扣分扣钱是否合法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从多个角度为您详细分析：
一、合法情况
绩效考核制度合法且明确
- 制度制定程序合法：如果公司的绩效考核制度经过了民主程序制定，如职工代表大会讨论通过，并且已向员工公示或告知，那么该制度具有法律效力。在此基础上，公司根据二次绩效考核结果进行扣分扣钱，通常是合法的。
- 考核标准具体明确：绩效考核制度中的考核标准应当具体、清晰，避免主观随意性大或模糊不清的指标。如果二次绩效考核的标准明确，且员工在考核前已知悉，那么公司依据该标准进行扣分扣钱也是合法的。
经济损失赔偿合法
- 当员工因故意或重大过失给公司造成经济损失时，公司可按照劳动合同约定要求其赔偿。如果二次绩效考核扣分扣钱与经济损失赔偿相关，且扣除比例符合《工资支付暂行规定》（即每月扣除部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准），那么这种扣钱行为是合法的。
二、不合法情况
绩效考核制度不合法或不明确
- 制度制定程序不合法：如果公司的绩效考核制度未经过民主程序制定，或未向员工公示告知，那么该制度可能不具有法律效力。在此基础上，公司依据该制度进行二次绩效考核扣分扣钱，可能是违法的。
- 考核标准模糊不清：如果二次绩效考核的标准模糊不清、随意变更，或无法提供充分的证据证明员工存在绩效不达标或其他违规行为，却仍然进行扣钱处理，这种行为也是不合法的。
扣除比例或金额不合法
- 扣除比例过高：即使绩效考核制度合法，但如果扣除的比例超过了法律规定的限制（即每月扣除部分不得超过员工当月工资的20%），那么这种扣钱行为也是违法的。
- 扣除后工资低于最低工资标准：如果扣除绩效工资后员工的实际工资低于当地最低工资标准，这种扣除也是违法的。最低工资标准是保障员工基本生活的法定底线，公司不得违反。
三、员工权益维护途径
- 与用人单位协商解决：员工首先应与用人单位沟通协商，了解二次绩效考核扣分扣钱的具体原因和依据，并表达自己的意见和诉求。
- 向劳动行政部门投诉：若协商无果，员工可向当地劳动行政部门投诉，寻求政府部门的帮助和支持。
- 申请劳动仲裁或提起诉讼：如问题仍无法解决，员工可向劳动仲裁机构申请仲裁，或在必要时向人民法院提起诉讼，通过法律途径来维护自身合法权益。
总结来说，公司二次绩效考核扣分扣钱是否合法，取决于绩效考核制度的合法性、明确性，扣除比例的合理性，以及扣除后工资是否低于最低工资标准等多个因素。员工在遇到此类问题时，应充分了解自己的权益和维权途径，并在必要时寻求法律帮助以确保自身权益不受侵害。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。