结论：房东与租客协议撤销营业执照这一行为本身，通常不会直接影响打官司的结果，但具体影响需结合案件性质、协议内容及双方争议焦点来综合判断。以下从不同角度进行详细分析：
一、协议撤销营业执照的法律性质
协议撤销营业执照，本质上可能是房东与租客就租赁房屋内营业执照的注销或变更达成的一致意见。这一行为主要涉及的是双方之间的合同关系或租赁关系中的一项具体约定，其法律性质属于民事法律行为。
二、对打官司可能的影响
合同纠纷角度：
- 如果双方因租赁合同产生纠纷，且撤销营业执照是合同中的一项条款或双方后续达成的补充协议内容，那么该协议的执行情况（即是否已撤销营业执照）可能成为判断双方是否违约、违约程度及责任承担的重要依据。
- 若协议明确约定了撤销营业执照的时间、方式及违约责任，而一方未履行，则可能构成违约，需承担相应的法律责任。但这并不直接决定官司的输赢，而是作为判断违约事实和责任的一个因素。
行政许可与合规角度：
- 营业执照的撤销或注销通常涉及行政许可的变更或终止，需遵循相关行政法规的规定。如果双方协议撤销营业执照的行为违反了行政法规的强制性规定（如未按规定程序办理注销手续），则该协议可能因违法而无效或部分无效。
- 在这种情况下，如果因协议无效或违法导致一方受损，受损方可能提起诉讼要求赔偿。但此时，协议撤销营业执照的行为本身并不直接决定官司的输赢，而是作为判断协议效力及责任承担的一个因素。
证据与事实认定角度：
- 在诉讼过程中，双方提交的证据和陈述的事实是法院判断案件事实和适用法律的基础。如果协议撤销营业执照的行为与案件事实相关，且双方对此存在争议，则该行为可能成为法院认定事实的一个关键点。
- 例如，如果租客主张因房东未协助撤销营业执照而导致其无法正常经营并遭受损失，那么房东是否已履行协助义务、营业执照是否已实际撤销等事实将成为判断房东是否应承担赔偿责任的重要依据。
三、建议与注意事项
- 明确协议内容：在签订租赁合同时或后续达成补充协议时，双方应明确约定营业执照的办理、使用、变更及注销等事项，包括具体的时间、方式、责任承担等条款，以避免后续产生争议。
- 遵守法律法规：在协议撤销营业执照的过程中，双方应严格遵守相关行政法规的规定，确保手续合法、合规。避免因违法操作而导致协议无效或承担不必要的法律责任。
- 保留证据：在协议履行过程中，双方应妥善保留与营业执照相关的所有证据和文件（如注销申请书、注销证明等），以便在发生争议时能够提供有力的证据支持自己的主张。
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