停运损失费原则上应由侵权人赔偿，若侵权人购买了商业三者险且保险公司未对停运损失免责条款尽到提示和说明义务，则保险公司也需在保险责任范围内赔付。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与赔偿原则
- 《中华人民共和国民法典》：该法规定，损坏他人财产的应当恢复原状或折价赔偿，若受害人因此遭受其他重大损失，侵害人也应赔偿损失。停运损失作为因交通事故导致的间接经济损失，属于应赔偿的范畴。
- 《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》：该解释第十二条明确指出，因道路交通事故造成依法从事货物运输、旅客运输等经营性活动的车辆无法从事相应经营活动所产生的合理停运损失，当事人请求侵权人赔偿的，人民法院应予支持。
二、赔偿主体与责任
侵权人赔偿：
- 在交通事故或其他侵权行为导致车辆停运的情况下，侵权人应承担停运损失的赔偿责任。
- 赔偿范围包括车辆维修期间无法正常运营所产生的经济损失，如营运收入损失等。
保险公司赔付：
- 若侵权人购买了商业三者险，且保险公司未就停运损失免责条款进行充分提示和说明，保险公司应在保险责任限额内对停运损失进行赔偿。
- 交强险通常不赔偿停运损失，因为交强险主要赔偿直接损失，如车辆维修费用、医疗费用等，而停运损失属于间接损失。但商业三者险的赔付情况需根据具体条款确定，若条款未将停运损失列为免责范围，则应予以赔偿。
三、赔偿金额的确定方法
考虑因素：
- 事故责任认定情况，确定侵权人的过错程度。
- 车辆实际停运时间，包括维修时间和必要的等待时间。
- 车辆正常运营时的收入情况，如营运收入证明、历史运营记录等。
- 相关证据的支持程度，确保赔偿金额的合理性。
评估流程：
- 收集并整理相关证据材料，包括事故认定书、维修记录、营运收入证明等。
- 由专业机构或法院指定的评估机构对停运损失进行评估。
- 根据评估结果确定具体的赔偿金额。
四、争议解决途径
- 协商处理：双方可首先尝试通过协商的方式解决争议，达成赔偿协议。
- 诉讼解决：若协商无果，受害方可向法院提起诉讼，由法院依法裁决。在诉讼过程中，双方应提供充分的证据支持各自的主张。
五、实际操作建议
- 保留证据：受害方应保留好相关证据，如营运资格证、许可证、事故责任认定书、维修发票、维修清单、停运期间的合同订单以及收入流水等，以证明停运损失的存在及具体数额。
- 及时索赔：受害方应及时向侵权人或其保险公司提出索赔要求，避免错过诉讼时效。
- 咨询专业律师：在处理此类问题时，建议咨询专业律师以确保权益得到充分保障。作为专业律师，我可以为你提供详细的法律咨询和诉讼代理服务。
综上所述，停运损失费的赔偿责任主体主要是侵权人，但在特定情况下保险公司也可能承担赔偿责任。赔偿金额的确定需综合考虑多种因素，并通过合法途径解决争议。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。