醉驾伤人案件中，若进行了两次酒精鉴定，责任认定书原则上以最后一次合法有效的鉴定结果为准，但需结合具体情形判断。以下是详细分析：

1. 鉴定程序的合法性是前提
   根据《道路交通安全违法行为处理程序规定》第三十五条，酒精检测需由两名以上交通警察进行，且检测仪器需经法定计量检定合格。若第一次鉴定存在程序违法（如未出示证件、仪器未校准），而第二次鉴定程序合法，则责任认定书会以第二次结果为准。例如，第一次检测时未按规定对当事人进行呼气前告知，导致证据无效，此时第二次合法检测结果会被采纳。

2. 鉴定结果的时效性影响效力
   酒精在人体内的代谢速度约为每小时0.015%-0.02%BAC（血液酒精浓度）。若两次检测间隔时间过长（如超过6小时），第一次结果可能因代谢而低于实际醉驾标准，此时第二次结果更接近行为时的真实状态。例如，第一次检测时间为事故后2小时（BAC 0.12%），第二次为8小时后（BAC 0.05%），若醉驾标准为0.08%，则第二次结果虽低于标准，但责任认定书可能结合第一次结果、行车轨迹等证据，综合认定行为时构成醉驾。

3. 复核申请的救济途径
   若当事人对第二次鉴定结果仍有异议，可在收到责任认定书后3日内向上一级公安机关交通管理部门申请复核。复核机构会重点审查鉴定程序是否合法、鉴定机构是否具备资质、鉴定方法是否科学等。例如，若第二次鉴定由无资质的机构出具，复核可能撤销原认定书并要求重新鉴定。

实务建议：

• 若您是当事人，收到责任认定书后应立即核对鉴定报告的编号、检测时间、机构资质等信息，发现程序瑕疵及时申请复核；
  
• 若您是受害方，可要求警方在责任认定书中详细说明两次鉴定结果的差异及采纳依据，必要时委托律师向法院申请重新鉴定；
  
• 无论何种情况，均需保留医疗记录、现场照片等证据，以辅助证明酒精检测结果与事故因果关系的关联性。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件细节。