员工入职体检造假、隐瞒怀孕事实，公司通常不能以此为由将其辞退。以下从不同角度对此问题进行分析：
一、法律依据与解读
《劳动合同法》的相关规定：
- 第八条：用人单位在招用劳动者时，有权了解与劳动合同直接相关的基本情况，但怀孕并不属于必须告知的基本信息。因此，员工隐瞒怀孕事实，并不构成提供虚假信息或欺诈行为。
- 第四十二条：明确规定了女职工在孕期、产期、哺乳期内的特殊保护，用人单位不得依据该法第四十条（非过失性辞退）和第四十一条（经济性裁员）的规定解除劳动合同。这意味着，即使员工隐瞒了怀孕事实，公司也不能因此将其辞退。
- 第三十九条：虽然规定了用人单位可以单方解除劳动合同的特定情形，如员工严重违反规章制度、严重失职等，但仅因隐瞒怀孕并不属于这些特定情形。
怀孕属于个人隐私：
- 怀孕是女性的基本权利和个人隐私，员工没有义务向单位如实告知。因此，隐瞒怀孕事实并不应被视为欺诈或违法行为。
二、合理性分析
隐瞒行为的普遍原因：
- 员工可能因担心就业歧视而选择隐瞒怀孕。在现实中，部分用人单位对怀孕女性存在偏见，导致女性员工为了获得平等就业机会而暂时隐瞒。
工作能力与怀孕无直接关系：
- 大多数情况下，怀孕女员工在孕期仍能够正常履行工作职责。因此，仅仅因为隐瞒怀孕而辞退员工是不合理的，也不符合法律法规的规定。
三、特殊情况与处理建议
特殊岗位的考虑：
- 如果员工所从事的岗位确实不适合孕妇，且公司在招聘时已明确告知岗位的特殊性，员工故意隐瞒怀孕并成功入职，公司可能有权依据《劳动合同法》第三十九条的规定，以员工严重违反公司规章制度为由单方解除劳动关系。但这种情况需要公司提供充分证据，证明员工明知岗位不适合孕妇仍故意隐瞒。
应对措施建议：
- 用人单位：发现员工隐瞒怀孕后，应以沟通和协商为主，合理安排工作任务和工作时间，确保员工能够在孕期正常工作。同时，加强内部管理，避免对怀孕女员工的歧视，营造公平、公正的就业环境。
- 员工：虽然怀孕是个人隐私，但在合适的时机应主动向用人单位说明情况，以便用人单位做出合理安排。同时，员工也应遵守公司规章制度，认真履行工作职责，维护良好的劳动关系。
四、法律后果
- 如果公司违法辞退怀孕员工，将构成违法解除劳动合同，需承担相应法律责任。根据《劳动合同法》的规定，公司可能需要支付赔偿金给员工，赔偿金的计算方式为：按照员工在公司的工作年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向员工支付半个月工资的经济补偿。如果员工的月工资高于公司所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
总结：员工入职时隐瞒怀孕事实，公司不能轻易将其辞退。公司应尊重员工的个人隐私和生育权利，遵守相关法律法规，确保员工的合法权益不受侵犯。同时，员工也应诚实透明地与公司沟通，共同维护和谐的劳动关系。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。