实际能获得的赔付为50万元。以下是详细分析：

1. 保单条款解读：车险保单中“每座赔付50万”的表述，明确界定了保险公司在每个座位上的赔付上限。在此案例中，车主为车辆购买了五个座位，每个座位的赔付限额均为50万元。这一条款是确定赔付金额的基础。

2. 事故情况分析：车主独自开车时发生事故导致死亡，此时车上仅有一个座位被占用，即车主所坐的座位。根据保单条款，保险公司将针对该被占用的座位进行赔付。

3. 赔付金额确定：由于只有一个座位被占用，且该座位的赔付限额为50万元，因此保险公司将按照这一限额进行赔付。即使车辆购买了五个座位，但未被占用的座位不会产生赔付。

4. 特殊情况考量：在一般情况下，车险保单的赔付不会因座位数量未全部占用而减少单个座位的赔付限额。除非保单中有特别约定，如“按实际座位占用数比例赔付”等，但此类约定较为罕见，且需明确体现在保单中。在此案例中，未提及此类特别约定，因此应按照每个座位50万元的限额进行赔付。