爷爷完全有权选择将遗产直接留给孙子，但需要通过合法有效的遗嘱或遗赠扶养协议来实现，且是否需要告知儿子，法律上没有强制要求，但出于家庭和谐考虑，建议进行适当沟通。以下从不同角度为您详细分析：
一、通过遗嘱继承或遗赠的方式
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，爷爷可以立遗嘱将个人财产指定由孙子继承，这在法律上被称为“遗嘱继承”。若爷爷选择将遗产的一部分或全部赠予孙子，则被称为“遗赠”。无论是遗嘱继承还是遗赠，都需要满足以下条件：
遗嘱的合法性：遗嘱必须符合法律规定的形式要件。例如，自书遗嘱需由遗嘱人亲笔书写、签名，并注明年、月、日；代书遗嘱则需有两个以上见证人在场见证，并由其中一人代书，同时由遗嘱人、代书人和其他见证人签名，注明年、月、日。打印遗嘱、录音录像遗嘱、口头遗嘱以及公证遗嘱等也都有其特定的法定要件。
明确指定：遗嘱中必须明确指定孙子为继承人或受遗赠人。
接受表示：在知道受遗赠后，孙子需要在六十日内作出接受或者放弃的表示，否则视为放弃。
是否需要告知儿子：法律上没有强制要求爷爷在立遗嘱时必须告知儿子。但考虑到家庭关系的和谐，以及避免未来可能出现的纠纷，建议爷爷在立遗嘱前或立遗嘱后，与儿子进行适当的沟通，说明自己的意愿和安排。
二、通过遗赠扶养协议的方式
爷爷还可以与孙子签订遗赠扶养协议，约定由孙子承担爷爷生养死葬的义务，并在爷爷去世后享有受遗赠的权利。遗赠扶养协议的效力优先于遗嘱继承和法定继承。
是否需要告知儿子：同样，法律上没有强制要求爷爷在签订遗赠扶养协议时必须告知儿子。但考虑到家庭关系的复杂性，以及孙子在承担生养死葬义务时可能需要儿子的协助或支持，建议爷爷在签订协议前或签订协议后，与儿子进行沟通，说明协议的内容和目的。
三、特殊情况：代位继承或儿子丧失继承权
代位继承：如果儿子（即孙子的父亲）先于爷爷去世，那么孙子可以依据《中华人民共和国民法典》第一千一百二十八条的规定，代位继承其父亲有权继承的遗产份额。这种情况下，爷爷无需特别立遗嘱或签订遗赠扶养协议，孙子即可依法获得遗产。
儿子丧失继承权：如果儿子因特定行为（如故意杀害被继承人、为争夺遗产而杀害其他继承人、遗弃被继承人或虐待被继承人情节严重等）丧失继承权，并经过法院判决确认，那么孙子有可能依据法定继承顺序或其他遗嘱安排获得遗产。这种情况下，爷爷同样无需特别告知儿子其已丧失继承权，但建议爷爷在处理遗产问题时，确保相关法律程序的合法性和有效性。
法律建议
确保遗嘱或遗赠扶养协议的合法性：爷爷在立遗嘱或签订遗赠扶养协议时，应严格遵守法律规定的形式和要件要求，以确保其法律效力。
考虑家庭关系的和谐：在处理遗产问题时，爷爷应充分考虑家庭成员之间的情感和关系，尽量通过沟通和协商达成共识，以避免未来可能出现的纠纷和矛盾。
寻求专业法律帮助：如果爷爷对遗嘱的订立或遗赠扶养协议的签订存在疑问或困惑，建议咨询专业律师以获取更详细和准确的法律建议。
希望以上分析能对您有所帮助。如果您有任何其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。