针对三方协议发生纠纷向哪里起诉的问题，结论前置如下：
一般原则：向被告住所地或合同履行地法院起诉
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，对于合同纠纷案件，原告通常可以向被告住所地或者合同履行地的人民法院提起诉讼。在三方协议纠纷中，若能明确被告（即违约方或责任方）的住所地，以及合同的具体履行地，那么原告可以选择向这两个地点中的任意一个法院提起诉讼。
特殊情况：协议管辖条款
- 如果三方协议中明确约定了发生纠纷时的管辖法院（即协议管辖条款），那么原告应当按照协议中的约定，向该约定的法院提起诉讼。这种约定通常具有优先效力，只要该约定不违反法律对级别管辖和专属管辖的规定。
多个被告或合同履行地不明确时的处理
- 在三方协议纠纷中，如果存在多个被告，且他们的住所地不在同一法院辖区内，或者合同履行地不明确，那么原告可以选择向其中一个被告的住所地法院提起诉讼，或者根据合同的具体内容和实际情况，确定一个合理的合同履行地，并向该地的法院提起诉讼。若仍无法确定，则可能需要根据案件的具体情况和法院的管辖权规定，进一步分析和判断。
详细解释与法律建议：
被告住所地与合同履行地的确定：
- 被告住所地通常指的是被告的户籍所在地或经常居住地。在提起诉讼前，原告需要尽可能准确地了解被告的住所地信息，以便确定管辖法院。
- 合同履行地则是指合同约定的履行义务的地点，或者根据合同内容和交易习惯能够确定的履行地点。在三方协议中，可能涉及多个履行义务，因此需要仔细分析合同条款，确定具体的履行地。
协议管辖条款的审查：
- 在签订三方协议时，各方应当仔细审查协议中的管辖条款，确保其合法有效且符合各方的利益。如果协议中约定了管辖法院，那么在发生纠纷时，各方应当遵守该约定，向约定的法院提起诉讼。
- 如果协议中的管辖条款存在模糊、不明确或违反法律规定的情形，那么该条款可能无效。此时，原告仍然需要按照一般原则，向被告住所地或合同履行地法院提起诉讼。
法律建议：
- 在提起诉讼前，原告应当充分收集证据，包括三方协议、履行合同的相关凭证、沟通记录等，以证明自己的主张和对方的违约行为。
- 如果对管辖法院存在疑问或不确定，原告可以咨询专业律师，以便更准确地确定管辖法院，并制定合适的诉讼策略。
可能遇到的法律后果：
- 如果原告错误地选择了管辖法院，那么被告可能会在答辩期内提出管辖权异议，导致案件被移送至有管辖权的法院审理。这不仅会延长诉讼时间，还可能增加诉讼成本。
- 因此，在提起诉讼前，原告应当谨慎选择管辖法院，确保自己的选择符合法律规定和案件实际情况。
总结与引导：
三方协议发生纠纷时，向哪里起诉是一个关键问题。原告应当根据被告住所地、合同履行地以及协议管辖条款等因素，综合判断并选择合适的管辖法院。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。