关于城管局制定共享单车申请增加数量是否合法的问题，这需要根据具体的法律法规和地方政策来综合判断。以下是我为您提供的详细分析：

首先，我们需要明确的是，行政机关在设定行政许可时，必须严格遵守行政许可法的相关规定。行政许可法明确规定，规章以下的规范性文件一律不得设定行政许可。这意味着，如果城管局仅通过规范性文件来设定共享单车申请增加数量的行政许可，那么这种做法在法律上可能是存在问题的。

从您提供的参考信息中，我们可以看到两个具体的案例：

1. 在“某公司不服江西省某市城市管理局不予批准新增共享电动车投放数量行政复议案”中，市城市管理局通过制定《某市中心城区共享电动自行车运营管理实施方案》来规定新增投放运营车辆需运营企业向城市管理局申请，并经批准同意后才能增加。然而，这一做法被行政复议机构认为违反了行政许可法对行政许可权设定的有关规定，最终该方案被废止，并实现了共享电动自行车市场的全面开放。

2. 在“市交通委对市十六届人大二次会议第1198号代表建议的答复”中，市交通管理部门对于共享单车的投放数量采取了“总量控制、动态调节”的总体思路，但并未通过规范性文件来设定具体的行政许可。相反，他们通过综合评估道路空间承载能力、非机动车停放设施资源等因素，来统筹兼顾市区与郊区的实际骑行需求，并鼓励引导单车企业均衡车辆投放。

结合上述两个案例，我们可以得出以下结论：

• 城管局或交通管理部门在制定共享单车投放数量相关政策时，必须严格遵守行政许可法的规定，不得通过规范性文件来设定行政许可。
• 如果地方政策或规章中确实需要对共享单车投放数量进行管理，那么应该通过合法、合规的方式来设定，比如通过制定地方性法规或政府规章来明确管理原则和措施。
• 在实际操作中，城管局或交通管理部门可以通过综合评估道路空间、停放设施、骑行需求等因素，来制定合理的投放数量管理方案，并鼓励引导单车企业根据市场需求和自身运营情况来自主决定投放数量。

综上所述，城管局制定共享单车申请增加数量是否合法，取决于其制定政策的具体方式和内容是否符合行政许可法等相关法律法规的规定。如果城管局仅通过规范性文件来设定行政许可，那么这种做法在法律上可能是不合法的。因此，在制定相关政策时，城管局应该严格遵守法律法规的规定，确保政策的合法性和合规性。