搜集医院主任收回扣的证据是一个复杂且需谨慎处理的过程，必须严格遵守法律规定，确保证据的合法性和有效性。以下是一些建议，但请注意，具体操作前务必咨询专业法律人士：

1. 明确证据类型与合法性：

   • 直接证据：如录音、录像、书面记录（如收据、转账记录、聊天记录等），这些能直接证明医院主任存在收受回扣行为的材料。但需注意，录音录像的获取必须合法，不得侵犯他人隐私或违反其他法律规定。
   • 间接证据：如证人证言、医院内部财务记录异常、药品或设备采购流程中的不合规现象等，这些虽不能直接证明，但结合其他证据可形成完整证据链。

2. 收集证据的具体方法：

   • 秘密调查：在确保不违法的前提下，可尝试秘密收集相关证据，如通过隐蔽拍摄（需确保不侵犯隐私）、记录异常交易等。但此方法风险较高，易引发法律纠纷，建议谨慎使用。
   • 公开渠道获取：通过医院公开的财务报告、采购记录、药品或设备供应商信息等，寻找可能的线索。这些信息虽不直接证明回扣行为，但可作为进一步调查的起点。
   • 鼓励内部举报：如果医院内部有员工知晓或参与回扣行为，可鼓励其向相关部门举报，并提供证据。但需注意保护举报人的隐私和安全。

3. 法律程序与注意事项：

   • 合法取证：所有证据的收集必须严格遵守法律规定，不得采用非法手段，如非法搜查、窃听、胁迫等。否则，证据可能被认定为非法证据而被排除。
   • 证据保全：收集到证据后，应及时进行保全，如复制、备份、封存等，以防证据丢失或被篡改。
   • 法律咨询：在收集证据前及过程中，务必咨询专业律师，确保每一步操作都合法合规，避免自身陷入法律风险。

4. 后续行动建议：

   • 向相关部门举报：一旦收集到足够证据，应向医院上级主管部门、卫生行政部门或纪检监察机关举报，并提供详细证据材料。
   • 考虑法律诉讼：如果回扣行为已构成犯罪，如受贿罪，可考虑向公安机关报案，通过刑事诉讼追究相关人员的法律责任。

搜集证据是一个复杂且敏感的过程，务必谨慎行事。如果你在此过程中遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。