在分居起诉离婚的情况下，关于抚养权的判定，虽然直接的法律条文可能并未明确提及“分居”作为唯一或决定性因素，但分居期间夫妻双方的行为、关系状态以及各自的条件等，都会成为法院综合考量抚养权归属的重要参考。以下是一些关键要点，帮助您理解分居起诉离婚时抚养权的判定标准：

一、分居期间与子女的相处情况

• 直接抚养与照顾：法院会关注分居期间，哪一方更直接地承担了子女的日常抚养、教育、医疗等责任。这包括日常的陪伴、接送上下学、参与学校活动、照顾生病等。
• 情感联系：除了物质上的照顾，法院还会考虑哪一方与子女建立了更紧密的情感联系。这体现在日常的沟通、互动、关心子女的心理需求等方面。

二、双方的经济条件与稳定性

• 经济能力：法院会评估双方的经济状况，包括收入、财产、负债等，以确定哪一方更有能力为子女提供稳定、良好的生活环境。
• 工作稳定性：稳定的工作和收入来源是保障子女生活品质的重要因素。法院会考虑双方的工作性质、职业前景以及工作稳定性。

三、子女的年龄与意愿

• 年龄因素：对于年幼的子女，法院可能更倾向于将抚养权判给能够提供更细致照顾的一方，通常是母亲（但并非绝对）。随着子女年龄的增长，法院会更多地考虑子女的意愿。
• 子女意愿：如果子女已达到一定年龄（通常认为是8周岁以上），法院会尊重其意愿，并考虑其选择抚养方的合理性。

四、分居原因与双方行为

• 分居原因：虽然分居本身不是决定抚养权归属的直接因素，但分居的原因（如感情不和、家庭暴力等）可能间接影响法院的判断。例如，如果分居是由于一方存在家庭暴力行为，法院可能更倾向于将抚养权判给另一方。
• 双方行为：法院会考察分居期间双方的行为表现，包括是否对子女有虐待、遗弃等不良行为，以及是否积极履行抚养义务等。

五、法律程序与综合考量

• 法律程序：抚养权的判定需通过法律程序进行，即向法院提起离婚诉讼，并在诉讼过程中提出抚养权的主张。
• 综合考量：法院在审理过程中，将综合考虑上述因素，以及子女的最佳利益原则，最终作出抚养权的判定。这包括考虑子女的身心健康、成长环境、教育需求等多方面因素。

实际操作建议

• 收集证据：在分居期间，建议双方都积极收集与子女抚养相关的证据，如日常照顾子女的照片、视频、医疗记录、学校活动记录等，以及各自的经济状况证明、工作证明等。
• 保持沟通：尽管分居，但双方仍应保持与子女的沟通，并尽量就抚养问题达成共识。如果无法达成共识，可以寻求专业律师或调解员的帮助。
• 尊重法院判决：最终，抚养权的判定将由法院根据法律程序和综合考量作出。双方应尊重法院的判决，并积极履行抚养义务。

总之，分居起诉离婚时抚养权的判定是一个综合考量的过程，涉及多个方面因素。希望以上信息能对您有所帮助。如有进一步疑问或需要专业法律建议，请咨询专业律师。