针对协议中对方虚假出资的情况，核心处理方式是依据协议约定和法律规定，通过协商、催告、解除协议或法律诉讼等途径来维护自身权益。以下是具体分析：

1. 核查协议条款与出资证据
   首先需仔细审查协议中关于出资方式、时间、金额及违约责任的条款，确认对方是否存在未按约定履行出资义务的行为。同时收集对方虚假出资的证据，如银行转账记录、资产评估报告、第三方验证文件等，以证明其未实际履行出资义务或出资不实。

2. 发送书面催告函
   在发现对方虚假出资后，可先通过律师函或正式书面通知要求对方在合理期限内补足出资或纠正违约行为。此步骤既为后续法律行动保留证据，也可能通过协商解决问题，避免诉讼成本。

3. 依据协议主张违约责任
   若协议中明确约定了虚假出资的违约责任（如违约金、赔偿损失等），可直接依据条款要求对方承担相应责任。例如，若协议规定“未按时出资需支付每日0.1%的违约金”，则可按此标准计算并主张赔偿。

4. 行使合同解除权
   若虚假出资行为导致协议目的无法实现（如合作项目因资金不足无法启动），可依据《民法典》第五百六十三条主张解除协议，并要求对方赔偿因解除造成的损失（如前期筹备费用、预期利益损失等）。

5. 通过诉讼或仲裁维权
   若协商、催告无果，可向法院提起诉讼或依据协议约定申请仲裁，要求对方：

   • 补足出资差额；
     
   • 支付违约金或赔偿实际损失；
     
   • 在股东资格纠纷中，可请求法院确认其不享有股东权利（如分红权、表决权等）。
     注：若涉及公司股东虚假出资，还可依据《公司法》及相关司法解释，要求其对公司债务在未出资范围内承担补充赔偿责任。

6. 特殊情形处理

   • 已办理工商登记但未实际出资：可要求对方限期缴纳出资，逾期未缴可启动股东除名程序（需符合《公司法解释三》第十七条条件）。
     
   • 出资财产价值显著低于约定：可要求对方补足差额，并追究其欺诈或违约责任。
     
   • 涉及刑事犯罪：若虚假出资行为涉嫌诈骗、虚报注册资本罪等，可向公安机关报案，追究其刑事责任。

建议行动步骤：

1. 立即固定证据（如协议、出资凭证、沟通记录等）；
   
2. 发送书面催告函并设定合理履行期限；
   
3. 评估是否符合解除协议条件，必要时委托律师起草法律文书；
   
4. 若对方拒不配合，尽快启动诉讼或仲裁程序，避免损失扩大。
   

如有进一步细节需要分析（如协议类型、出资方式、损失范围等），可直接向我咨询，我会结合具体情形提供更精准的解决方案。