在交通事故案件中，关于法院判决保险公司承担诉讼费、鉴定费的法律依据，主要可以归纳为以下几点：
一、鉴定费承担的法律依据
《中华人民共和国保险法》第六十四条
- 该条款明确规定，保险人、被保险人为查明和确定保险事故的性质、原因和保险标的的损失程度所支付的必要的、合理的费用，包括鉴定费，应由保险人承担。在交通事故中，若车辆已投保，那么为了明确事故损失而进行的鉴定费用，如车辆定损鉴定、伤残鉴定等，通常应由保险公司承担。
《诉讼费用交纳办法》第十二条及第二十九条
- 第十二条规定，诉讼过程中因鉴定等发生的费用，由当事人根据“谁主张、谁负担”的原则直接支付给有关机构。这意味着，在诉讼过程中，鉴定费用原则上由申请方先行垫付。
- 第二十九条则进一步规定，诉讼费用由败诉方负担，部分胜诉、部分败诉的，法院根据案件具体情况决定当事人各自负担的费用数额。这一规定同样适用于鉴定费用的最终承担。因此，在交通事故案件中，如果法院判决保险公司败诉或部分败诉，那么鉴定费用可能会由保险公司承担或按比例分担。
二、诉讼费承担的法律依据
- 《诉讼费用交纳办法》第二十九条
- 该条款不仅适用于鉴定费用，也适用于诉讼费用的承担。在交通事故案件中，如果法院判决保险公司败诉，那么诉讼费用（包括案件受理费、申请费等）通常也会由保险公司承担。如果保险公司部分胜诉、部分败诉，法院则会根据案件具体情况决定其应承担的诉讼费用数额。
三、具体承担情形与考虑因素
责任明确情况下的承担
- 若交通事故责任明确，且保险公司被判决承担赔偿责任，那么鉴定费用和诉讼费用通常应由保险公司承担。
双方均有责任时的分担
- 当双方均对事故负有责任时，鉴定费用和诉讼费用可能会根据各自的责任比例进行分担。法院或相关机构会根据事故具体情况判定责任比例，并据此决定费用的分配。
特殊情况的考虑
- 不同地区可能会根据当地实际情况出台具体的司法实践指导意见，对鉴定费和诉讼费的承担作出细化规定。这些规定可能考虑到公平原则和保护受害者权益，要求保险公司即使合同中有不予理赔的约定，也需承担一定比例的费用。
四、实际操作建议
- 在处理交通事故时，建议当事人及时咨询专业律师以获取准确的法律意见和帮助。律师可以根据具体案情和法律规定，为当事人提供有针对性的法律建议和策略规划，包括如何合理主张鉴定费用和诉讼费用的承担。
综上所述，法院判决保险公司承担交通事故案件中的诉讼费、鉴定费，主要依据《中华人民共和国保险法》和《诉讼费用交纳办法》的相关规定。在具体案件中，法院会根据案件情况、当事人责任以及相关法律法规综合考虑，确定费用的最终承担方。