关于民法典下法院自赔国家赔偿与判令企业单位重复赔偿的法律依据问题，首先明确结论：在现行法律框架下，法院自赔的国家赔偿与企业单位赔偿通常不会重复，二者在性质、目的及适用条件上存在显著差异，且法律明确禁止重复受偿。以下从多个角度进行详细分析：
一、法院自赔的国家赔偿与企业单位赔偿的性质与目的
法院自赔的国家赔偿：
- 性质：根据《中华人民共和国国家赔偿法》（以下简称《国家赔偿法》），国家赔偿是指国家机关及其工作人员在行使职权过程中，因违法侵犯公民、法人或其他组织的合法权益而造成损害时，由国家承担的赔偿责任。
- 目的：旨在弥补因国家机关的违法行为给受害人造成的损失，体现国家对公民权利的尊重和保护。
企业单位赔偿：
- 性质：企业单位赔偿通常基于民事法律关系，如合同违约、侵权等，由企业单位因其过错行为给受害人造成的损失承担赔偿责任。
- 目的：旨在恢复或补偿受害人因企业单位的过错行为而遭受的损失，维护市场秩序和公平正义。
二、法律禁止重复受偿的原则
- 法律依据：根据《国家赔偿法》及相关民事法律规定，受害人不得因同一损害事实而同时获得国家赔偿和企业单位赔偿。这一原则体现了法律的公平性和合理性，防止受害人因同一损害获得超额补偿。
- 实践应用：在司法实践中，如果受害人已经通过民事诉讼获得了企业单位的赔偿，那么在其申请国家赔偿时，法院会扣除已经获得的赔偿部分，以避免重复受偿。
三、具体情形下的法律适用
国家机关违法行为与企业单位过错行为并存：
- 如果国家机关的违法行为与企业单位的过错行为共同导致了受害人的损害，且二者之间存在因果关系，那么受害人可以分别向国家机关和企业单位主张赔偿。但赔偿总额不得超过其实际损失，即不得重复受偿。
国家机关违法行为独立导致损害：
- 如果损害完全是由国家机关的违法行为导致的，与企业单位无关，那么受害人只能向国家机关主张国家赔偿，而不能向企业单位主张赔偿。
企业单位过错行为独立导致损害：
- 如果损害完全是由企业单位的过错行为导致的，与国家机关无关，那么受害人只能向企业单位主张赔偿，而不能向国家机关主张国家赔偿。
四、法律建议
- 对于受害人：在遭受损害时，应首先明确损害的原因和责任主体，然后根据实际情况选择合适的赔偿途径。如果同时涉及国家机关和企业单位，应注意避免重复受偿。
- 对于国家机关和企业单位：应加强内部管理，规范行为，避免违法行为和过错行为的发生，从而减少赔偿纠纷的发生。
综上所述，民法典下法院自赔的国家赔偿与企业单位赔偿通常不会重复，二者在性质、目的及适用条件上存在显著差异。受害人应根据实际情况选择合适的赔偿途径，并注意避免重复受偿。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。