贪污金额的认定应以其实际非法占有或控制的金额为准，在此案例中，行为人贪污金额应认定为3万元，但需对转给领导的1万元承担共同贪污的刑事责任。具体分析如下：
贪污金额的认定原则：
- 贪污罪是指国家工作人员利用职务上的便利，侵吞、窃取、骗取或者以其他手段非法占有公共财物的行为。
- 在认定贪污金额时，通常以其实际非法占有或控制的金额为准。这包括行为人直接占有的部分，以及通过他人间接占有的部分（如果这部分金额能够明确归属于行为人的贪污行为）。
本案中的贪污金额分析：
- 行为人按照领导的指示贪污了3万元，这是其贪污行为的总额。
- 其中，1万元转给了领导，这部分金额虽然最终由领导占有，但仍是行为人贪污行为的一部分。行为人不能因为将部分贪污所得转给他人而免除这部分金额的刑事责任。
- 然而，在认定行为人个人的贪污金额时，应以其实际非法占有或控制的金额为准。如果行为人没有将这部分1万元视为自己所有，而是明确知道这是为领导贪污的，那么这部分金额在认定行为人个人贪污金额时可能不被直接计入，但行为人仍需对这1万元承担共同贪污的刑事责任。
- 在实际操作中，由于行为人与领导之间存在共同贪污的故意和行为，因此整个3万元都可能被视为他们共同贪污的金额。但在对行为人个人进行量刑时，法院可能会考虑其实际非法占有或控制的金额，以及其在共同贪污中的作用和地位。
法律责任与量刑：
- 行为人作为贪污行为的直接实施者，无论其是否将部分贪污所得转给他人，都应对整个贪污行为承担刑事责任。
- 在量刑时，法院会综合考虑贪污金额、行为人的认罪态度、退赃情况、在共同犯罪中的作用和地位等因素。
- 如果行为人能够积极退赃、认罪悔罪，并如实供述自己的罪行和同案犯的情况，可能会在量刑时得到一定的从轻处理。
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