结论：基于您描述的情况，使用违法占用农田地建的厂房的租赁合同，通常无法成功变更营业执照。以下从法律背景、法律建议和可能的法律后果三个角度进行详细分析：
法律背景
土地用途管制：
- 根据我国《土地管理法》的相关规定，国家实行土地用途管制制度，严格限制农用地转为建设用地。任何单位和个人不得非法占用农用地进行非农业建设，包括建造厂房等。
- 如果厂房是违法占用农田地建造的，那么该厂房本身就属于违法建筑，其存在和使用的合法性都受到质疑。
营业执照变更的条件：
- 营业执照的变更通常要求经营场所的合法性。如果经营场所是违法建筑，那么相关部门在审核营业执照变更申请时，很可能会因为经营场所不合法而拒绝变更。
法律建议
核查厂房合法性：
- 在考虑变更营业执照之前，您应该首先核查厂房的合法性。如果厂房确实是违法占用农田地建造的，那么您需要认识到这种行为的法律风险。
- 如果可能的话，您可以尝试与厂房的建造者或所有者协商，看是否能够通过合法途径（如补办用地手续、拆除重建等）使厂房合法化。
咨询当地相关部门：
- 在尝试变更营业执照之前，建议您先咨询当地的市场监管部门或工商行政管理部门，了解他们对违法建筑作为经营场所的具体态度和政策。
- 同时，您也可以咨询当地的土地管理部门，了解厂房所占土地的用途和性质，以及是否有可能通过合法途径改变土地用途。
考虑法律风险：
- 如果您明知厂房是违法建筑而仍然使用其作为经营场所，并尝试变更营业执照，那么您可能会面临法律风险。一旦被发现，您可能会受到行政处罚，甚至可能面临刑事责任。
可能的法律后果
行政处罚：
- 如果您使用违法建筑作为经营场所，并因此被相关部门查处，那么您可能会面临罚款、没收违法所得、责令停产停业等行政处罚。
刑事责任：
- 在极端情况下，如果您明知厂房是违法建筑而仍然使用，并因此造成了严重后果（如环境污染、安全事故等），那么您可能会面临刑事责任。
总结与进一步行动建议：基于上述分析，我建议您在考虑变更营业执照之前，先核查厂房的合法性，并咨询当地相关部门了解具体政策和态度。如果厂房确实是违法建筑，那么您应该考虑寻找其他合法的经营场所，以避免法律风险。如果您有任何进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。