调查令在一定条件下可以用于查询工程款，但具体能否查询以及查询的范围和方式，需结合以下情况分析：

1. 调查令的适用范围
   调查令是法院授权律师或当事人向第三方（如银行、企业、行政机关等）调取证据的司法文书。若工程款涉及诉讼且与案件事实直接相关（如工程款支付纠纷、合同履行争议等），法院通常可签发调查令，要求相关单位提供工程款支付记录、合同、结算文件等证据。

2. 查询工程款的具体条件

   • 诉讼关联性：工程款需与当前诉讼案件有直接关联（如原告主张被告拖欠工程款，需调取付款凭证证明欠款事实）。
     
   • 证据必要性：若当事人已自行收集部分证据，但需第三方补充（如银行流水、税务发票等），法院可能依申请签发调查令。
     
   • 第三方配合义务：被调查单位（如银行、建设单位、财务部门等）需在法律范围内配合提供证据，否则可能面临法院强制措施。

3. 实际操作中的限制

   • 隐私与商业秘密：若工程款涉及个人隐私或企业商业秘密（如内部财务数据），调查令可能需明确查询范围，避免过度披露。
     
   • 跨地区查询：若工程款支付方与诉讼法院不在同一地区，需通过法院协作机制或委托当地法院调取，可能增加程序复杂度。
     
   • 证据形式要求：调查令通常要求提供书面材料或电子数据，若需现场勘验或询问证人，可能需另行申请法院调查。

建议：若您需通过调查令查询工程款，首先需确认诉讼案件与工程款的关联性，并准备初步证据（如合同、付款记录等）向法院申请。若遇到第三方拒绝配合或证据形式复杂，可进一步向我咨询具体应对方案。