结论前置：公司制度违法的情形下，复印件在符合一定条件时可以作为证据使用，但需结合其他证据形成完整证据链，且其证明力可能受到原件核对、证据来源合法性等因素影响。以下从法律角度详细分析：

一、复印件作为证据的合法性基础

根据《民事诉讼法》第七十条及《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第十一条，书证应当提交原件，但提交原件确有困难的（如原件由对方掌握、原件灭失等），可提交与原件核对无误的复印件或复制件。因此，复印件本身并非绝对无效，但需满足“与原件核对无误”或“其他证据佐证”等条件。

举例说明：若员工主张公司制度违法（如未依法支付加班费），并提交制度复印件，同时提供工资条、考勤记录等证据证明制度实际执行情况，此时复印件可与其他证据相互印证，形成完整证据链。

二、复印件作为证据的证明力限制

1. 原件核对优先：根据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第九十条，无法与原件核对的复印件，若对方提出异议且无其他证据佐证，可能不被采信。因此，尽可能通过公证、对方自认等方式固定复印件与原件的一致性。
2. 证据来源合法性：若复印件系通过非法手段获取（如偷拍、窃取），可能因证据来源不合法被排除。例如，员工私自拍摄公司未公开的制度文件，若公司主张该文件系内部机密，法院可能以侵犯商业秘密为由不予采纳。
3. 证据内容完整性：复印件需完整反映制度内容，若存在删减、篡改痕迹，其证明力将大幅降低。例如，员工仅提交制度中关于“加班审批”的条款复印件，却隐瞒“加班需自愿”的后续条款，可能构成断章取义。

三、公司制度违法的法律后果与证据作用

若公司制度确实违法（如违反《劳动法》关于加班、休假、工资支付的规定），员工可依据《劳动合同法》第三十八条主张解除劳动合同并要求经济补偿。此时，复印件的证明力直接影响员工诉求能否成立：

• 若复印件被采信：法院可能认定公司存在违法行为，支持员工诉求；
• 若复印件未被采信：员工需补充其他证据（如证人证言、录音录像等），否则可能承担举证不能的不利后果。

四、实务建议

1. 优先获取原件：通过协商、申请劳动仲裁或诉讼中的证据调取程序，尽可能获取制度原件；
2. 完善证据链：将复印件与工资条、考勤记录、工作邮件等证据结合，证明制度实际执行情况；
3. 咨询专业律师：针对具体案情，律师可协助设计取证策略（如申请公证、证据保全），提高复印件的证明力。

总结：复印件在符合法律条件时可作为证据，但其证明力需结合其他证据综合判断。若您遇到公司制度违法问题，可直接向我咨询，我将结合具体案情提供法律分析。