医方不认可死因时，司法鉴定机构仍然可以进行鉴定，但具体能否鉴定及鉴定的可行性会受到多种因素的影响。以下从不同角度进行分析：
一、法律依据与鉴定条件
《医疗事故处理条例》的相关规定：
- 根据《医疗事故处理条例》第十八条，若患者死亡且死因不明，或医患双方对死因存在争议，应在患者死亡后48小时内进行尸检（具备尸体冻存条件可延至7日内）。尸检是确定死因的直接手段，但并非进行医疗事故鉴定的唯一前提。
- 若医患双方对死因无争议，或有其他充分证据（如病历、影像资料、专家意见等）证明医疗行为与损害后果的因果关系，鉴定机构仍可能受理医疗事故鉴定。
未尸检的鉴定可能性：
- 在未进行尸检的情况下，如果病历资料完整、诊断记录明确，且能证明医疗过错与死亡结果之间的直接关系，鉴定机构仍然可以进行医疗事故鉴定。
- 但若死因存疑且未尸检，鉴定机构可能因证据不足无法确认因果关系，导致患方举证困难。
二、医方不认可死因的影响
医方责任与举证：
- 若医方不认可死因，但拒绝或拖延尸检，导致死因无法判定，根据《医疗事故处理条例》第十八条，医方可能承担不利后果，如推定过错。
- 医方有义务提供真实、完整的病历资料，以支持鉴定机构进行准确的因果关系判断。若医方提供的病历资料不真实、不完整，可能影响鉴定的进行和结果。
鉴定机构的独立性与客观性：
- 鉴定机构在受理医疗事故鉴定时，会独立、客观地审查医患双方提供的证据材料，包括病历资料、影像资料、专家意见等。
- 医方不认可死因并不直接影响鉴定机构的鉴定工作，但可能增加鉴定的复杂性和难度。鉴定机构会根据现有证据材料，结合医学知识和临床经验，进行综合分析判断。
三、实际操作建议
医患协商与尸检：
- 若死因存疑，建议医患双方尽量通过协商或法律程序申请尸检，以固定关键证据。尸检是确定死因的直接手段，有助于减少后续纠纷和争议。
- 若患方拒绝尸检，需书面记录并明确责任，避免后续纠纷。医方也应积极履行告知义务，确保患方了解尸检的必要性和重要性。
替代证据的收集与提供：
- 在未进行尸检的情况下，医患双方应积极收集其他证据材料，如病历资料、影像资料、专家意见等，以支持各自的诉求。
- 医方应提供真实、完整的病历资料，并配合鉴定机构进行调查和询问。患方也应积极提供与纠纷有关的证据材料，以协助鉴定机构进行准确的因果关系判断。
司法鉴定途径的选择：
- 若医疗事故鉴定因证据不足无法进行，医患双方可考虑通过司法鉴定（如过错鉴定）辅助诉讼。司法鉴定机构会根据现有证据材料进行综合分析判断，并出具相应的鉴定结论。
- 在选择司法鉴定机构时，医患双方应选择具有相应资质和经验的机构进行鉴定，以确保鉴定结论的准确性和公正性。
总结来说，医方不认可死因并不直接影响司法鉴定机构进行鉴定。但未进行尸检可能增加鉴定的复杂性和难度，影响鉴定结论的准确性和公正性。因此，在发生医疗纠纷后，医患双方应积极协商、收集证据材料，并选择合适的鉴定机构进行鉴定，以维护各自的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。