交通肇事罪存疑不起诉后，驾驶证是否会被吊销并不完全取决于检察院是否起诉，而是基于具体的交通肇事行为、后果以及相关法律法规的规定。即使检察院作出不起诉决定，驾驶证在某些情况下仍可能被吊销。以下是对此问题的详细分析：

一、检察院不起诉的情况与驾驶证吊销的关系

1. 法定不起诉（绝对不起诉）：

   • 若交通肇事行为虽不构成刑事犯罪，但违反了道路交通安全法规，且达到了吊销驾驶证的条件（如酒驾、严重超速等），驾驶证依然会被吊销。

2. 酌定不起诉（相对不起诉）：

   • 尽管检察院基于犯罪情节轻微决定不起诉，但若交通肇事行为本身属于应当吊销驾驶证的情形（如肇事逃逸、醉酒驾驶等），驾驶证通常还是会被吊销。

3. 存疑不起诉（证据不足不起诉）：

   • 若仅因证据不足而不起诉，但现有证据能证明存在应当吊销驾驶证的交通违法行为，驾驶证仍有可能被吊销。例如，虽然证据不足以证明构成交通肇事罪，但足以证明存在酒驾或超速等违法行为，这些行为本身就可能导致驾驶证被吊销。

二、构成犯罪与驾驶证吊销的关系

• 法律规定：根据《中华人民共和国道路交通安全法》第一百零一条，违反道路交通安全法律、法规的规定，发生重大交通事故并构成犯罪的，依法追究刑事责任，并由公安机关交通管理部门吊销机动车驾驶证。
• 实践应用：即使检察院因各种因素（如肇事者主观恶性小、积极赔偿等）决定不起诉，但如果肇事行为确实构成了交通肇事罪，公安机关交通管理部门仍有权根据具体情况吊销驾驶证。

三、特殊情况下的驾驶证吊销

• 饮酒、吸毒后驾驶：无论交通肇事后果是否严重，只要存在饮酒、吸毒后驾驶的行为，驾驶证通常都会被吊销。
• 肇事逃逸：交通肇事后为逃避法律追究而逃跑的行为，一旦查实，即使检察院不起诉，驾驶证也会被吊销，且根据法律规定，可能面临终生不得重新取得机动车驾驶证的严厉限制。

四、综合判断与建议

• 综合判断：驾驶证是否会被吊销，最终取决于具体的交通肇事行为和后果，以及公安机关交通管理部门的决定。在处理交通肇事案件时，应综合考虑肇事行为的性质、情节、社会危害程度以及肇事者的态度等因素。
• 建议：驾驶者应严格遵守道路交通安全法规，确保安全驾驶。在发生交通肇事后，应积极配合调查，主动承担责任，以减轻可能的法律后果。如果对驾驶证的处理结果有异议，可以在规定时间内申请行政复议或提起行政诉讼来维护自己的合法权益。

综上所述，交通肇事罪存疑不起诉并不意味着驾驶证不会被吊销。驾驶者在驾驶过程中应时刻保持警惕，遵守交通规则，以确保自身和他人的安全。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。