借款关系本身不因出借人被查而失效，借款人仍需按约定还款，但需关注资金来源合法性对合同效力的潜在影响及后续处理方式。以下从不同角度展开分析：

1. 借款合同效力与还款义务

根据《民法典》第六百七十五条，借款人应按约定期限返还借款。即使出借人因贪污被查，借款合同本身的效力不受影响（除非能证明借款时出借人明知资金为非法所得且恶意串通损害他人利益，但此类情形需举证，实践中极少见）。因此，您作为借款人仍需履行还款义务，否则可能面临被起诉、强制执行等法律风险。

2. 资金来源合法性对合同的影响

若出借人贪污所得的20万被认定为赃款，根据《民法典》第一百五十三条，违反法律、行政法规强制性规定的民事法律行为无效。但需注意：

• 区分借款行为与资金来源：借款行为本身是合法的民事法律关系，仅因资金来源违法不直接导致合同无效，除非能证明双方恶意串通（如明知资金为赃款仍借款）。
• 赃款追缴规则：若20万被认定为赃款，司法机关可能依法追缴，但追缴对象是出借人或实际持有赃款的人，而非借款人。若您已还款，且还款资金为合法所得，一般无需返还；若未还款，司法机关可能要求您将款项直接支付至指定账户（如退赔被害人或上缴国库），而非返还给出借人。

3. 实务建议

• 核实资金性质：若出借人已被立案调查，可向办案机关（如纪委、检察院）了解20万是否被认定为赃款。若未被认定，按原合同还款；若被认定，需配合司法机关处理。
• 保留证据：保存借款合同、转账记录、沟通记录等，证明借款事实及资金流向，避免因出借人被查导致还款对象不明。
• 协商处理：若出借人被羁押或财产被查封，可与其家属或办案机关协商还款方式（如直接退赔被害人或上缴国库），并留存书面协议。
• 法律风险防范：若出借人要求您通过虚假诉讼、转移财产等方式逃避追缴，务必拒绝，否则可能涉嫌共同犯罪。

4. 特殊情形：出借人死亡或财产被没收

若出借人因贪污被判处没收财产，其合法财产（如其他收入）仍可用于偿还债务，但赃款部分需优先退赔被害人或上缴国库。若出借人死亡，其债务由遗产继承人在继承范围内承担，但赃款部分不纳入遗产。

总结：您需按约还款，但需关注资金来源合法性。若20万被认定为赃款，可能需配合司法机关直接退赔或上缴，而非返还给出借人。建议尽快咨询律师，根据具体案情制定方案。如有进一步疑问，可直接向我提问。