核心结论：针对普通发票已入账但对方不肯付款的情况，法律上主要从合同关系、发票管理规定以及诉讼救济途径这几个方面进行规范和处理。以下为你详细阐述：
- 合同关系层面
- 合同效力与付款义务：在商业交易中，双方通常会签订合同来明确各自的权利和义务。如果已经签订了合法有效的合同，其中明确约定了付款的时间、方式等条款，那么对方不肯付款就构成了违约行为。根据《中华人民共和国民法典》合同编的规定，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。在这种情况下，你可以依据合同要求对方履行付款义务，如果对方仍然拒绝，你可以通过法律途径来维护自己的权益，比如向法院提起诉讼，要求对方支付货款以及可能产生的违约金、利息等。
- 合同未明确约定的情况：即使合同中没有明确约定付款的具体细节，但根据交易习惯和行业惯例，对方也有合理的付款义务。例如，在一般的买卖合同中，买方在收到货物并验收合格后，就应当按照约定的时间或者合理的时间内支付货款。如果对方无正当理由拒绝付款，同样构成违约，你可以要求其承担相应的责任。
- 发票管理规定层面
- 发票的性质与作用：普通发票是在购销商品、提供或接受服务以及从事其他经营活动中，所开具和收取的收付款凭证。虽然发票的开具在一定程度上可以作为交易发生的证据，但它本身并不直接等同于付款的证明。也就是说，你开具了普通发票并已入账，只能说明你与对方之间存在交易行为，但不能直接证明对方已经支付了货款。
- 发票与付款的关联性：在实际操作中，有些合同可能会约定以发票的开具作为付款的条件之一，但这需要双方在合同中有明确的约定。如果没有这样的约定，对方不能仅仅以已经收到发票为由拒绝付款。如果对方以发票问题作为不付款的借口，你可以提供其他证据来证明对方尚未付款，比如送货单、对账单、聊天记录等，以证明你的主张。
- 诉讼救济途径层面
- 准备证据材料：如果与对方协商无果，你决定通过诉讼来解决纠纷，那么需要准备充分的证据材料来支持你的诉讼请求。除了前面提到的合同、送货单、对账单、聊天记录等证据外，还可以提供发票的存根联、记账联等，以证明交易的真实性和金额。同时，要注意证据的合法性、真实性和关联性，确保证据能够有效地证明你的主张。
- 起诉与诉讼流程：你可以向有管辖权的人民法院提起诉讼，提交起诉状和相关证据材料。法院在受理案件后，会依法进行审理，并根据事实和法律规定作出判决。如果对方在判决生效后仍然不履行付款义务，你可以向法院申请强制执行，通过法院的强制力来迫使对方履行义务。
温馨提示：在处理此类纠纷时，建议你先与对方进行友好协商，尝试通过沟通解决问题，这样可以节省时间和成本。如果协商不成，再考虑通过法律途径来维护自己的权益。如果你还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，欢迎随时向我咨询。