员工签署的不仲裁相关协议，其有效性需分情况讨论，并非绝对有效或无效。以下从不同角度为你详细分析：

协议内容合法且不违反强制性规定时

1. 若协议内容合法，且不违反法律、行政法规的强制性规定，同时不存在欺诈、胁迫等情形，该协议通常是有效的。例如，员工和公司在平等自愿的基础上，协商一致约定通过其他合法途径（如协商、调解）解决劳动争议，而不选择仲裁，这样的约定是受到法律保护的。因为根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，解决劳动争议，应当根据事实，遵循合法、公正、及时、着重调解的原则，依法保护当事人的合法权益。双方约定其他合法解决方式，并不违背这一原则。

协议内容违法或违反强制性规定时

1. 若协议内容违法，或者违反法律、行政法规的强制性规定，该协议则是无效的。比如，协议中约定员工放弃所有劳动权益，包括但不限于工资、加班费、社会保险等，这样的约定因为违反了法律的强制性规定，损害了员工的合法权益，所以是无效的。即使员工签署了这样的协议，也不能因此丧失其依法享有的劳动权益。
2. 若协议存在欺诈、胁迫等情形，导致员工在违背真实意思的情况下签署，该协议同样无效。例如，公司以辞退、降薪等手段威胁员工签署不仲裁协议，员工为了保住工作而被迫签署，这样的协议因为缺乏员工的真实意思表示，所以也是无效的。

协议部分有效部分无效时

1. 还有一种情况是，协议中的部分条款可能因违法或违反强制性规定而无效，但其他条款仍然有效。比如，协议中既约定了通过协商解决劳动争议，又约定了员工放弃某些劳动权益。在这种情况下，关于通过协商解决争议的约定可能是有效的，但关于放弃劳动权益的约定则是无效的。

法律建议：

• 在签署任何协议之前，员工都应仔细阅读协议内容，确保自己完全理解并同意其中的条款。
• 如果对协议内容有任何疑问或不确定之处，建议咨询专业律师或法律机构，以获取准确的法律意见。
• 如果发现协议中存在违法或违反强制性规定的条款，员工有权拒绝签署，并可以向相关部门投诉或寻求法律援助。

可能后果：

• 如果员工签署了有效的不仲裁协议，并且后续发生劳动争议，那么双方可能需要按照协议约定的方式解决争议，而不是通过仲裁途径。
• 如果员工签署了无效的不仲裁协议，并且后续发生劳动争议，员工仍然有权依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以维护自己的合法权益。

希望以上分析能对你有所帮助。如果你有任何其他关于劳动纠纷的问题，都可以直接向我咨询。