鉴定人出庭费用由人民法院负担的依据主要来源于《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定。具体分析如下：
法律依据：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百九十八条：“法庭审理过程中，当事人和辩护人、诉讼代理人有权申请通知新的证人到庭，调取新的物证，申请重新鉴定或者勘验。法庭对于上述申请，应当作出是否同意的决定。第二款规定：经人民法院通知，鉴定人拒不出庭作证的，鉴定意见不得作为定案的根据。同时，虽然该法条未直接规定鉴定人出庭的费用由谁负担，但结合相关司法实践和法律原则，可以推断出鉴定人因出庭而产生的合理费用应由人民法院负担。这是因为鉴定人出庭是履行其法定职责，为了保障诉讼的顺利进行和司法公正，其因出庭而产生的费用理应由国家（即人民法院代表）承担。
- 进一步地，虽然直接的刑事诉讼法条可能未明确提及费用负担，但参照《中华人民共和国民事诉讼法》第八十二条关于“当事人申请鉴定人出庭作证的费用，由申请方先行垫付，最终由败诉方承担”的规定（虽为民诉法，但体现了法律对于鉴定人出庭费用负担的一般原则），以及司法实践中对于刑事案件中鉴定人出庭费用通常由人民法院根据实际情况进行合理负担的做法，可以认为在刑事案件中，鉴定人出庭的费用也应由人民法院负担，特别是当鉴定人出庭是应人民法院通知而进行时。不过，需要注意的是，这里的“负担”并不意味着人民法院会直接支付给鉴定人所有费用，而是会根据实际情况，如鉴定人因出庭而产生的交通费、住宿费、误工费等合理费用，进行合理补偿。
司法实践：
- 在司法实践中，人民法院通常会根据鉴定人的实际出庭情况，如出庭时间、地点、产生的费用等，进行合理评估，并决定是否给予补偿以及补偿的数额。这种做法既体现了对鉴定人劳动的尊重，也保障了诉讼的顺利进行。
特殊情况：
- 如果鉴定人出庭是应一方当事人的申请，且该申请最终未被法庭采纳，或者鉴定人出庭后其鉴定意见未被法庭采信，那么在这种情况下，要求申请方或者鉴定意见未被采信的一方承担部分或全部出庭费用，也是合理的。但这并非绝对，具体还需根据案件情况和法庭的裁量来决定。不过，在大多数情况下，特别是当鉴定人出庭是应人民法院通知而进行时，其出庭费用还是由人民法院负担。
总结来说，鉴定人出庭费用在刑事案件中通常由人民法院负担，这是基于保障诉讼顺利进行和司法公正的考虑。当然，具体费用负担情况还需根据案件实际情况和法庭的裁量来决定。如果您有进一步的法律问题或需要更详细的解释，请直接向我咨询。