结论前置：质量保证协议上仅盖“仅供存档使用”的章，一般来说，这样的盖章行为可能不足以使协议产生预期的法律效力，具体还需结合协议内容、双方实际履行情况及盖章行为的具体背景等因素综合判断。以下从不同角度进行分析：

1. 盖章行为的法律意义：

   • 在合同法律关系中，盖章通常被视为合同成立或生效的要件之一，它代表了合同一方对合同内容的认可和接受。然而，“仅供存档使用”的章，从字面意义上看，更多表示该文件或协议仅用于存档目的，而非作为双方权利义务的依据。
   • 若协议中明确约定了双方的权利义务，且双方均按照协议内容实际履行，那么即使协议上盖的是“仅供存档使用”的章，该协议仍可能因双方的实际履行行为而被认定为有效。但这种情况需要具体证据支持，如双方的实际交易记录、沟通记录等。

2. 协议内容与盖章行为的匹配性：

   • 如果质量保证协议的内容详尽且明确，涵盖了双方对质量标准、验收方式、违约责任等方面的约定，而盖章行为只是形式上的瑕疵，且双方均按照协议内容实际履行，那么该协议仍可能被认定为有效。
   • 然而，如果协议内容模糊或存在争议，且盖章行为又表明了“仅供存档使用”的意图，那么这可能会成为对方抗辩协议无效或部分无效的理由。

3. 实际履行情况的影响：

   • 合同的法律效力不仅取决于合同的形式和内容，还取决于双方的实际履行情况。如果双方均按照质量保证协议的内容实际履行了各自的义务，如供应商提供了符合质量标准的产品，采购方也按照约定支付了货款，那么即使协议上盖的是“仅供存档使用”的章，该协议仍可能被视为有效。
   • 相反，如果双方未按照协议内容实际履行，或者存在违约行为，那么盖章行为可能会成为对方主张协议无效或追究违约责任的依据。

4. 法律建议：

   • 为了避免潜在的纠纷和风险，建议在签订质量保证协议时，使用正式的合同章或公章，并明确约定双方的权利义务、质量标准、验收方式、违约责任等条款。
   • 如果已经签订了盖有“仅供存档使用”章的质量保证协议，且双方均按照协议内容实际履行了各自的义务，那么可以保留相关证据（如交易记录、沟通记录等），以备不时之需。
   • 如果对协议的法律效力存在疑虑或争议，建议及时咨询专业律师，以便根据具体情况提供针对性的法律建议和解决方案。

总结：质量保证协议上仅盖“仅供存档使用”的章，其法律效力需结合协议内容、双方实际履行情况及盖章行为的具体背景等因素综合判断。为了确保协议的法律效力，建议使用正式的合同章或公章，并明确约定双方的权利义务。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。