擅自填埋农村坑塘水面的行为属于违法行为，需承担相应的法律责任，具体处理方式需根据行为后果及法律规定来确定。以下从不同角度进行分析：

1. 行政责任角度
   根据《中华人民共和国土地管理法》及《中华人民共和国水法》的相关规定，农村坑塘水面属于农村集体土地中的水域用地，其使用需严格遵守土地和水资源管理法规。擅自填埋可能构成非法改变土地用途或破坏水资源的行为，相关部门（如自然资源部门、水利部门）有权责令停止违法行为，限期恢复原状，并可处以罚款。具体罚款标准需结合地方性法规及行为后果的严重程度确定。

2. 民事责任角度
   若填埋行为导致周边土地、水域生态受损（如排水不畅、地下水污染、农作物减产等），或侵害了其他村民的合法权益（如灌溉用水权、渔业养殖权等），受害方有权要求行为人承担民事赔偿责任。赔偿范围包括直接经济损失（如修复费用、产量损失）及间接损失（如生态修复费用），需通过协商或诉讼途径解决。

3. 刑事责任角度
   在极端情况下，若填埋行为导致严重后果（如引发地质灾害、污染环境达到刑事立案标准等），可能触犯《中华人民共和国刑法》中的相关罪名。例如，若填埋行为导致土地严重毁坏，可能构成“非法占用农用地罪”；若造成重大环境污染事故，可能构成“污染环境罪”。刑事责任的认定需以司法机关的调查和判决为准。

建议处理步骤：

1. 立即停止违法行为：避免损失进一步扩大；
   
2. 与相关部门沟通：主动向当地自然资源部门、水利部门或乡镇政府报告，说明情况并配合调查；
   
3. 评估损害后果：委托专业机构对生态损害进行评估，为后续责任承担提供依据；
   
4. 协商或诉讼解决：若涉及民事赔偿，可优先通过协商解决；协商不成，可通过法律途径维权。
   

温馨提示：农村土地和水资源管理涉及多方利益，任何改造行为均需依法依规进行。若您有进一步疑问或需要具体法律指导，可直接向我咨询，我将结合您的实际情况提供详细解答。