结论：在民间借贷欠40万且房产被保全的情况下，法院不一定会拍卖您的房产，是否拍卖取决于多种因素。以下分情况详细说明：

1. 保全与拍卖的性质和目的不同

   • 保全：法院对您的房产进行保全，是一种临时性的强制措施，目的是防止您在诉讼过程中转移、隐匿、变卖财产，以确保将来判决能够得到有效执行。保全并不意味着房产一定会被拍卖，只是限制了您对该房产的一些处分权利，比如不能随意出售、抵押等。
   • 拍卖：拍卖房产是在判决生效后，如果您未按照判决履行还款义务，债权人向法院申请强制执行，法院在经过一定的程序后，为了实现债权人的债权，才会对您的房产进行拍卖。

2. 影响法院是否拍卖房产的因素

   • 还款情况：如果在诉讼过程中或者判决生效后，您能够积极与债权人协商，达成还款协议并按照协议履行还款义务，那么法院就不会拍卖您的房产。例如，您可以与债权人协商分期还款，在约定的期限内逐步偿还欠款。
   • 房产价值与债务金额的关系：如果您的房产价值明显高于40万的债务金额，法院在拍卖时可能会考虑保留一定的剩余价值给您。在这种情况下，法院可能会更倾向于通过其他方式促使您还款，而不是直接拍卖房产。相反，如果房产价值接近或者低于债务金额，法院拍卖房产以清偿债务的可能性就会增加。
   • 是否存在其他可供执行的财产：法院在执行过程中，会全面调查您的财产状况。如果您除了这套房产外，还有其他可供执行的财产，如车辆、存款、股权等，法院可能会先执行这些财产，而不急于拍卖您的房产。
   • 债权人的意愿：债权人也可以在一定程度上影响法院是否拍卖房产。如果债权人认为通过其他方式能够实现债权，或者考虑到拍卖房产可能带来的成本和风险，可能会同意不拍卖房产，而是采取其他执行措施。

3. 如果面临房产被拍卖的情况，您可以采取的措施

   • 提出执行异议：如果您认为法院的执行行为违反了法律规定，或者对拍卖房产的程序、方式等有异议，可以在规定的时间内向法院提出执行异议。法院会对您的异议进行审查，并根据审查结果作出相应的处理。
   • 与债权人协商和解：在执行过程中，您仍然可以与债权人进行协商，尝试达成和解协议。例如，您可以提出增加还款期限、降低利息等条件，以换取债权人不拍卖您的房产。
   • 自行变卖房产：在法院允许的情况下，您可以自行寻找买家变卖房产，并将所得款项用于偿还债务。这种方式可能会比法院拍卖房产获得更高的价格，从而减少您的损失。

建议：如果您面临民间借贷纠纷且房产被保全的情况，建议您及时与债权人沟通，了解其诉求和意愿，同时积极收集相关证据，如还款记录、财产状况等，以维护自己的合法权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。